21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0911 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0911  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  588  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.514281  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0998  hypothetical protein  61.81 
 
 		 309 aa  358  4e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00422743 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  46.92 
 
 		 1005 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  50.54 
 
 		 1017 aa  102  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  42.71 
 
 		 1401 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  44.09 
 
 		 1401 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  38.14 
 
 		 1176 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  41.67 
 
 		 1025 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.78 
 
 		 1891 aa  70.5  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  45.71 
 
 		 1331 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  41.67 
 
 		 1643 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  28.81 
 
 		 925 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  34.04 
 
 		 1248 aa  62  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  34.44 
 
 		 1847 aa  56.2  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  38.46 
 
 		 1975 aa  55.8  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  33.7 
 
 		 2068 aa  52.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  31.52 
 
 		 1307 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  29.59 
 
 		 752 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  28.57 
 
 		 853 aa  43.5  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  29.59 
 
 		 2638 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  42.37 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>