37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1851 on replicon NC_013164
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013164  Apre_1851  hypothetical protein  100 
 
 
515 aa  999    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000113905  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1385  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.58 
 
 
515 aa  82  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2894  sensor histidine kinase  29.06 
 
 
529 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0785038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2958  two-component sensor histidine kinase  28.08 
 
 
529 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000113024  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  23.86 
 
 
466 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  22.96 
 
 
466 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  22.96 
 
 
466 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  22.96 
 
 
466 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  22.96 
 
 
466 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  21.56 
 
 
470 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  22.96 
 
 
466 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  22.96 
 
 
466 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3115  histidine kinase  23.53 
 
 
483 aa  53.9  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0486  putative signal transduction histidine kinase  22.35 
 
 
408 aa  52.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.47 
 
 
486 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  20.14 
 
 
429 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4905  ATPase domain-containing protein  19.93 
 
 
496 aa  51.2  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.92947  normal  0.728538 
 
 
-
 
NC_002936  DET1530  sensor histidine kinase  23.37 
 
 
191 aa  50.4  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00284281  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.86 
 
 
513 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1368  histidine kinase  21.16 
 
 
525 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2866  histidine kinase  23.12 
 
 
469 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.81 
 
 
471 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.79 
 
 
461 aa  47.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
445 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10862  two component sensor kinase  23.02 
 
 
425 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.889894  hitchhiker  0.000152401 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  23.45 
 
 
451 aa  46.6  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4393  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.64 
 
 
582 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4526  histidine kinase  23.64 
 
 
582 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.218354 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1345  histidine kinase  28.23 
 
 
338 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000383255 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1768  histidine kinase  20.9 
 
 
666 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.686261  normal  0.0755696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0729  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.8 
 
 
398 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.29297  normal  0.836482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.04 
 
 
472 aa  44.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 
561 aa  44.3  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  22.05 
 
 
460 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.62 
 
 
594 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.05 
 
 
480 aa  43.5  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.05 
 
 
480 aa  43.5  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0241273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>