94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1385 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1385  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 
515 aa  993    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2958  two-component sensor histidine kinase  26.38 
 
 
529 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000113024  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2894  sensor histidine kinase  26.01 
 
 
529 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0785038  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1851  hypothetical protein  30.58 
 
 
515 aa  81.6  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000113905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0188  histidine kinase  31.31 
 
 
693 aa  63.9  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  26.92 
 
 
653 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1033  sensor protein comP  26.63 
 
 
762 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000608596  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0623  histidine kinase  20.29 
 
 
403 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000090  sensor histidine protein kinase UhpB glucose-6-phosphate specific  24.34 
 
 
500 aa  57.8  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  24.62 
 
 
514 aa  57  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  23.35 
 
 
527 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  22.27 
 
 
439 aa  55.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25610  histidine kinase  21.74 
 
 
458 aa  54.7  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.309786 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.34 
 
 
513 aa  53.9  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  20.1 
 
 
575 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3746  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.35 
 
 
688 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  19.61 
 
 
575 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5349  two-component sensor histidine kinase  20.93 
 
 
452 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0266421 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  19.61 
 
 
575 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  21.43 
 
 
450 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4526  histidine kinase  18.95 
 
 
582 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.218354 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4393  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  18.95 
 
 
582 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  19.51 
 
 
740 aa  50.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.29 
 
 
347 aa  50.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  25.26 
 
 
1063 aa  50.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  18.09 
 
 
417 aa  50.4  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1368  histidine kinase  25.63 
 
 
525 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.43 
 
 
448 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  42.05 
 
 
670 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.35 
 
 
426 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0276057  hitchhiker  0.000366543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.16 
 
 
553 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1774  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
519 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.737179  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  27.01 
 
 
585 aa  48.5  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2961  ATP-binding region ATPase domain protein  27.14 
 
 
645 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.10084  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.84 
 
 
513 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3424  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.44 
 
 
378 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164628  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  19.81 
 
 
480 aa  48.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  18.89 
 
 
470 aa  48.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0789  histidine kinase  21.08 
 
 
273 aa  47.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.57147 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0763  sensor histidine kinase  25.94 
 
 
763 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0673199  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5260  ComP, putative  23.58 
 
 
772 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  23.36 
 
 
1017 aa  47.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 
408 aa  47.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00145033  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3697  histidine kinase  20 
 
 
313 aa  47  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5445  histidine kinase  23.4 
 
 
478 aa  47  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.403934  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  23.47 
 
 
497 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  19.86 
 
 
598 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  20.14 
 
 
598 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5914  histidine kinase  25 
 
 
288 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0349357  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.59 
 
 
366 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 
359 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.52 
 
 
490 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0082  sensory histidine kinase UhpB  20.33 
 
 
509 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.908057  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4131  sensory histidine kinase UhpB  20.33 
 
 
509 aa  45.8  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.812455  normal  0.258097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  24.29 
 
 
645 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  24.62 
 
 
364 aa  45.8  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3077  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.44 
 
 
378 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4079  sensory histidine kinase UhpB  20.33 
 
 
509 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1603  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  21.72 
 
 
470 aa  45.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0696  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.38 
 
 
790 aa  46.2  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3241  Histidine kinase  26.15 
 
 
393 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4291  histidine kinase  23.98 
 
 
954 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.608548  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  19.47 
 
 
359 aa  45.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.87 
 
 
359 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  19.8 
 
 
665 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 
359 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  19.11 
 
 
386 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  23.11 
 
 
392 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2626  putative signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 
372 aa  44.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4068  histidine kinase  22.09 
 
 
383 aa  44.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.419226 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 
359 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  23.39 
 
 
466 aa  44.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3302  histidine kinase  19.28 
 
 
455 aa  44.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5092  two-component sensor protein  21.15 
 
 
523 aa  44.3  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0321  sensor histidine kinase, putative  22.07 
 
 
339 aa  44.3  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  21.24 
 
 
381 aa  44.3  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  21.24 
 
 
381 aa  44.3  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  22.47 
 
 
461 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  17.5 
 
 
660 aa  44.3  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  22.22 
 
 
482 aa  44.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  22.87 
 
 
359 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  21.6 
 
 
523 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  20.98 
 
 
515 aa  43.9  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6820  histidine kinase  24.02 
 
 
278 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.0817727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  20.1 
 
 
485 aa  43.9  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0681  sensory box histidine kinase  19.17 
 
 
356 aa  43.5  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5592  sensor histidine kinase  20.19 
 
 
523 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  25.69 
 
 
525 aa  43.9  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2136  histidine kinase  28.14 
 
 
638 aa  43.9  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204065  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4420  sensor histidine kinase  24.62 
 
 
766 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0037892  normal  0.407304 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5507  sensor histidine kinase  21.15 
 
 
523 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  24.51 
 
 
1101 aa  43.5  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  22.89 
 
 
456 aa  43.1  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4552  histidine kinase  35.23 
 
 
738 aa  43.5  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00113459  normal  0.0314449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>