120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5965 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5965  50S ribosomal protein L32  100 
 
 		 60 aa  123  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4030  ribosomal protein L32  70.18 
 
 		 59 aa  85.5  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09480  50S ribosomal protein L32  81.67 
 
 		 60 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.145627 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1575  50S ribosomal protein L32  70.18 
 
 		 59 aa  82  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0654579 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2781  50S ribosomal protein L32  68.33 
 
 		 59 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.147785  normal  0.143209 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0650  50S ribosomal protein L32  66.67 
 
 		 58 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1285  50S ribosomal protein L32  68.97 
 
 		 57 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.761755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1175  50S ribosomal protein L32  68.97 
 
 		 57 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000516362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0211  ribosomal protein L32  65 
 
 		 58 aa  77.4  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2274  ribosomal protein L32  63.79 
 
 		 64 aa  76.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11280  LSU ribosomal protein L32P  62.07 
 
 		 64 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1608  50S ribosomal protein L32  60.34 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1667  50S ribosomal protein L32  58.62 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.294477  normal  0.0177766 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1882  ribosomal protein L32  77.19 
 
 		 59 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0381708  normal  0.0158979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3434  ribosomal protein L32  63.16 
 
 		 58 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.976937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7996  ribosomal protein L32  71.67 
 
 		 59 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1137  50S ribosomal protein L32  58.62 
 
 		 56 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131577  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2294  ribosomal protein L32  58.62 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252255  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1040  50S ribosomal protein L32  52.38 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2615  ribosomal protein L32  58.62 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.499524 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0335  ribosomal protein L32  53.7 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10230  ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000453136  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1625a  50S ribosomal protein L32  41.67 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100343  normal  0.018062 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1229  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037109  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0825  50S ribosomal protein L32  46.55 
 
 		 58 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369841  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2134  50S ribosomal protein L32  48.28 
 
 		 60 aa  51.6  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000309957  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2502  50S ribosomal protein L32  46.88 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.801451  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2240  50S ribosomal protein L32  46.88 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000311506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3692  ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 64 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4845  50S ribosomal protein L32  70.97 
 
 		 57 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.784807  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1886  50S ribosomal protein L32  70.97 
 
 		 57 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.193978 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1355  LSU ribosomal protein L32P  41.38 
 
 		 57 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130715  normal  0.0921955 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08890  50S ribosomal protein L32  45.31 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1873  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 60 aa  48.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00104363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1941  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000297405  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2559  ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 60 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1643  50S ribosomal protein L32P  52.63 
 
 		 59 aa  47.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2805  ribosomal protein L32  46.77 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4302  50S ribosomal protein L32  70.97 
 
 		 57 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4388  50S ribosomal protein L32  70.97 
 
 		 57 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4682  50S ribosomal protein L32  70.97 
 
 		 57 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.32504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8018  ribosomal protein L32  65.52 
 
 		 57 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1103  ribosomal protein L32  45 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000214959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3824  50S ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 59 aa  47.4  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000535994  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0135  50S ribosomal protein L32  50.85 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114527  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0637  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 59 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000215733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3110  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0115825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1152  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1740  50S ribosomal protein L32  41.67 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000325807  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1844  50S ribosomal protein L32  40.68 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000652015  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1006  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 57 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1275  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00245853  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0718  50S ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 57 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204019  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0013  50S ribosomal protein L32  43.64 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4160  50S ribosomal protein L32  78.57 
 
 		 58 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1599  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 60 aa  45.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.919739  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1434  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740742  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2368  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0171  50S ribosomal protein L32  49.15 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1579  50S ribosomal protein L32  43.33 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.146664  normal  0.0105145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1558  ribosomal protein L32  75 
 
 		 56 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0900428  decreased coverage  0.00889428 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1904  50S ribosomal protein L32  43.33 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0519443  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1259  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000760142  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0952  ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000023662  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1848  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0940  ribosomal protein L32  36.84 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000379015  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1611  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0069978  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1086  50S ribosomal protein L32  39.66 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0656  ribosomal protein L32  38.98 
 
 		 59 aa  44.3  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179278  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0473  50S ribosomal protein L32  44.26 
 
 		 60 aa  43.9  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000488467  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0775  50S ribosomal protein L32  44.07 
 
 		 60 aa  43.9  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000368381  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0798  50S ribosomal protein L32  44.07 
 
 		 60 aa  43.9  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2752  50S ribosomal protein L32  41.67 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1058  ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000694342  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1026  50S ribosomal protein L32P  43.64 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000147931  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0271  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.750719  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1187  50S ribosomal protein L32  37.5 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1209  50S ribosomal protein L32  37.5 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000286453  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1729  ribosomal protein L32  40.68 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000316991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2844  50S ribosomal protein L32  41.67 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2936  50S ribosomal protein L32  41.67 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4414  ribosomal protein L32  59.46 
 
 		 53 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000688865  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1025  50S ribosomal protein L32  41.67 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3969  50S ribosomal protein L32  36.84 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00129021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3774  50S ribosomal protein L32  36.84 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000267221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3665  50S ribosomal protein L32  36.84 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.37288e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3682  50S ribosomal protein L32  36.84 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000568057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4062  50S ribosomal protein L32  36.84 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1786  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.213514  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0916  50S ribosomal protein L32  38.33 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2488  50S ribosomal protein L32  47.46 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2573  50S ribosomal protein L32  36.84 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000210481  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1878  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3750  50S ribosomal protein L32  36.84 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162679  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0184  50S ribosomal protein L32  43.33 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00725165  normal  0.800579 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3976  50S ribosomal protein L32  36.84 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4024  50S ribosomal protein L32  36.84 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1217  50S ribosomal protein L32  36.84 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3938  50S ribosomal protein L32  36.84 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1364  ribosomal protein L32  44.07 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000136875  normal  0.339824 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>