35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2502 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2502  50S ribosomal protein L32  100 
 
 
67 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.801451  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2240  50S ribosomal protein L32  100 
 
 
67 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000311506 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08890  50S ribosomal protein L32  83.33 
 
 
67 aa  117  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1375  50S ribosomal protein L32  73.13 
 
 
67 aa  80.1  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.043806  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2615  ribosomal protein L32  54.55 
 
 
59 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.499524 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4030  ribosomal protein L32  50.75 
 
 
59 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1608  50S ribosomal protein L32  52.24 
 
 
66 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233748  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1667  50S ribosomal protein L32  49.25 
 
 
64 aa  55.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.294477  normal  0.0177766 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1285  50S ribosomal protein L32  50 
 
 
57 aa  53.9  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.761755  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1575  50S ribosomal protein L32  52.83 
 
 
59 aa  53.5  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0654579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0211  ribosomal protein L32  46.97 
 
 
58 aa  52.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1175  50S ribosomal protein L32  50 
 
 
57 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000516362 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2274  ribosomal protein L32  55.07 
 
 
64 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11280  LSU ribosomal protein L32P  46.27 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3434  ribosomal protein L32  89.29 
 
 
58 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.976937  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4845  50S ribosomal protein L32  68.57 
 
 
57 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.784807  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5965  50S ribosomal protein L32  46.88 
 
 
60 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1558  ribosomal protein L32  63.41 
 
 
56 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0900428  decreased coverage  0.00889428 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1386  ribosomal protein L32  58.14 
 
 
57 aa  50.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0650  50S ribosomal protein L32  48.48 
 
 
58 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21540  LSU ribosomal protein L32P  68.42 
 
 
54 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0096297  hitchhiker  0.000173407 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3288  ribosomal protein L32  60.98 
 
 
57 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.541236  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1137  50S ribosomal protein L32  44.78 
 
 
56 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131577  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1886  50S ribosomal protein L32  65.71 
 
 
57 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.193978 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2781  50S ribosomal protein L32  75 
 
 
59 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.147785  normal  0.143209 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4160  50S ribosomal protein L32  58.14 
 
 
58 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4302  50S ribosomal protein L32  65.71 
 
 
57 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4388  50S ribosomal protein L32  65.71 
 
 
57 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14482  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4682  50S ribosomal protein L32  65.71 
 
 
57 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.32504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2294  ribosomal protein L32  100 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252255  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4414  ribosomal protein L32  75 
 
 
53 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000688865  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13280  LSU ribosomal protein L32P  53.49 
 
 
56 aa  41.6  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0352088  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1040  50S ribosomal protein L32  43.55 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1882  ribosomal protein L32  52.24 
 
 
59 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0381708  normal  0.0158979 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0825  50S ribosomal protein L32  40.3 
 
 
58 aa  40  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>