27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4414 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4414  ribosomal protein L32  100 
 
 		 53 aa  103  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000688865  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21540  LSU ribosomal protein L32P  66.04 
 
 		 54 aa  68.2  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0096297  hitchhiker  0.000173407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1558  ribosomal protein L32  71.7 
 
 		 56 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0900428  decreased coverage  0.00889428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4160  50S ribosomal protein L32  66.04 
 
 		 58 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4845  50S ribosomal protein L32  58.49 
 
 		 57 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.784807  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4302  50S ribosomal protein L32  58.49 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4388  50S ribosomal protein L32  58.49 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4682  50S ribosomal protein L32  58.49 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.32504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3288  ribosomal protein L32  56.6 
 
 		 57 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.541236  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1886  50S ribosomal protein L32  58.49 
 
 		 57 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.193978 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13280  LSU ribosomal protein L32P  56.6 
 
 		 56 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0352088  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3434  ribosomal protein L32  69.7 
 
 		 58 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.976937  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2615  ribosomal protein L32  60.87 
 
 		 59 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.499524 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1386  ribosomal protein L32  54.72 
 
 		 57 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1575  50S ribosomal protein L32  56.1 
 
 		 59 aa  45.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0654579 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4030  ribosomal protein L32  62.5 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2502  50S ribosomal protein L32  75 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.801451  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2240  50S ribosomal protein L32  75 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000311506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5965  50S ribosomal protein L32  59.46 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08890  50S ribosomal protein L32  71.43 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1137  50S ribosomal protein L32  75 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131577  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1608  50S ribosomal protein L32  60.61 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0211  ribosomal protein L32  75 
 
 		 58 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11280  LSU ribosomal protein L32P  54.29 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2781  50S ribosomal protein L32  75 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.147785  normal  0.143209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2274  ribosomal protein L32  51.35 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0650  50S ribosomal protein L32  75 
 
 		 58 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>