31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21540 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_21540  LSU ribosomal protein L32P  100 
 
 		 54 aa  110  9e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0096297  hitchhiker  0.000173407 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1386  ribosomal protein L32  62.96 
 
 		 57 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4414  ribosomal protein L32  66.04 
 
 		 53 aa  68.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000688865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1558  ribosomal protein L32  65.38 
 
 		 56 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0900428  decreased coverage  0.00889428 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3288  ribosomal protein L32  61.11 
 
 		 57 aa  64.3  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.541236  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4845  50S ribosomal protein L32  59.26 
 
 		 57 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.784807  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1886  50S ribosomal protein L32  57.41 
 
 		 57 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.193978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4302  50S ribosomal protein L32  61.11 
 
 		 57 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4388  50S ribosomal protein L32  61.11 
 
 		 57 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4682  50S ribosomal protein L32  61.11 
 
 		 57 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.32504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4160  50S ribosomal protein L32  61.54 
 
 		 58 aa  61.6  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13280  LSU ribosomal protein L32P  53.7 
 
 		 56 aa  57.4  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0352088  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2615  ribosomal protein L32  56.6 
 
 		 59 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.499524 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08890  50S ribosomal protein L32  68.57 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2240  50S ribosomal protein L32  68.42 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000311506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2502  50S ribosomal protein L32  68.42 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.801451  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4030  ribosomal protein L32  85.19 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1608  50S ribosomal protein L32  82.76 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3434  ribosomal protein L32  85.19 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.976937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0211  ribosomal protein L32  85.19 
 
 		 58 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1575  50S ribosomal protein L32  77.78 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0654579 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1667  50S ribosomal protein L32  75.86 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.294477  normal  0.0177766 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11280  LSU ribosomal protein L32P  75.86 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2274  ribosomal protein L32  61.54 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0650  50S ribosomal protein L32  79.31 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1137  50S ribosomal protein L32  63.89 
 
 		 56 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131577  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1285  50S ribosomal protein L32  90.48 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.761755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2294  ribosomal protein L32  95.24 
 
 		 65 aa  42.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252255  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1175  50S ribosomal protein L32  90.48 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000516362 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5965  50S ribosomal protein L32  90.48 
 
 		 60 aa  42  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2781  50S ribosomal protein L32  90.91 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.147785  normal  0.143209 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>