146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2294 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2294  ribosomal protein L32  100 
 
 		 65 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252255  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1667  50S ribosomal protein L32  74.19 
 
 		 64 aa  101  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.294477  normal  0.0177766 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11280  LSU ribosomal protein L32P  74.19 
 
 		 64 aa  99.8  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2274  ribosomal protein L32  74.19 
 
 		 64 aa  99  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1608  50S ribosomal protein L32  68.85 
 
 		 66 aa  88.2  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2781  50S ribosomal protein L32  71.7 
 
 		 59 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.147785  normal  0.143209 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1285  50S ribosomal protein L32  67.86 
 
 		 57 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.761755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1175  50S ribosomal protein L32  67.86 
 
 		 57 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000516362 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0650  50S ribosomal protein L32  62.5 
 
 		 58 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0211  ribosomal protein L32  64.15 
 
 		 58 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0335  ribosomal protein L32  56.45 
 
 		 64 aa  78.2  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4030  ribosomal protein L32  63.16 
 
 		 59 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7996  ribosomal protein L32  71.43 
 
 		 59 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5965  50S ribosomal protein L32  58.62 
 
 		 60 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1040  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3434  ribosomal protein L32  60 
 
 		 58 aa  67  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.976937  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1575  50S ribosomal protein L32  57.41 
 
 		 59 aa  66.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0654579 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2615  ribosomal protein L32  59.32 
 
 		 59 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.499524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1137  50S ribosomal protein L32  53.57 
 
 		 56 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131577  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0637  50S ribosomal protein L32  49.09 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000215733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1873  50S ribosomal protein L32  50.88 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00104363  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3692  ribosomal protein L32  50.88 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1152  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1941  50S ribosomal protein L32  49.15 
 
 		 61 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000297405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3110  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0115825  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0825  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 58 aa  60.5  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369841  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1364  ribosomal protein L32  50.88 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000136875  normal  0.339824 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2134  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000309957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10230  ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 57 aa  57.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000453136  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1259  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 58 aa  57.4  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000760142  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1434  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 58 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740742  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2078  ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0182296  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1599  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.919739  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1786  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.213514  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1740  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000325807  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0952  ribosomal protein L32  43.64 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000023662  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1174  ribosomal protein L32  39.29 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000264274  normal  0.0273197 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1229  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037109  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0013  50S ribosomal protein L32  49.06 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1026  50S ribosomal protein L32P  48.21 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000147931  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3554  50S ribosomal protein L32  49.09 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0940  ribosomal protein L32  39.68 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000379015  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2559  ribosomal protein L32  43.64 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1882  ribosomal protein L32  63.16 
 
 		 59 aa  52.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0381708  normal  0.0158979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0743  ribosomal protein L32  38.33 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1355  LSU ribosomal protein L32P  42.11 
 
 		 57 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130715  normal  0.0921955 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1597  50S ribosomal protein L32  44.26 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000469826  normal  0.427035 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1369  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00758434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1340  ribosomal protein L32  46.15 
 
 		 58 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.5028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2121  50S ribosomal protein L32  62.5 
 
 		 57 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.151407 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1890  ribosomal protein L32  39.39 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3824  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000535994  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0855  ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 59 aa  50.8  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08890  50S ribosomal protein L32  85.71 
 
 		 67 aa  50.8  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1665  50S ribosomal protein L32  43.64 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0871064  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1420  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.640468  normal  0.982205 
 
 
-
 
NC_002936  DET1275  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00245853  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09480  50S ribosomal protein L32  58.62 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.145627 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2614  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2368  50S ribosomal protein L32  43.64 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2502  50S ribosomal protein L32  57.69 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.801451  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1272  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.165805 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1910  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1086  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05660  LSU ribosomal protein L32P  45.61 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00609202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2240  50S ribosomal protein L32  57.69 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000311506 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1625a  50S ribosomal protein L32  35.71 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100343  normal  0.018062 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0770  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 56 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000008111  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1329  ribosomal protein L32  38.46 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150645  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf408  ribosomal protein L32  36.67 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0718  50S ribosomal protein L32  38.18 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204019  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0386  50S ribosomal protein L32  40.68 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0173336  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1859  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 68 aa  48.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898391  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2988  ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000138033  normal  0.0167419 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl396  50S ribosomal protein L32  42.31 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00156688  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4845  50S ribosomal protein L32  47.17 
 
 		 57 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.784807  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1103  ribosomal protein L32  38.1 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000214959  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0657  ribosomal protein L32  41.27 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0135  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114527  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1187  50S ribosomal protein L32  39.22 
 
 		 57 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1209  50S ribosomal protein L32  39.22 
 
 		 57 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000286453  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0836  50S ribosomal protein L32  38.33 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369284  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2752  50S ribosomal protein L32  39.66 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1718  50S ribosomal protein L32  38.18 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.220434  normal  0.0708692 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0171  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2844  50S ribosomal protein L32  39.66 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2936  50S ribosomal protein L32  39.66 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0473  50S ribosomal protein L32  37.93 
 
 		 60 aa  47  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000488467  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0233  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 60 aa  47  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000487517  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21540  LSU ribosomal protein L32P  79.31 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0096297  hitchhiker  0.000173407 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0775  50S ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000368381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2741  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 59 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0798  50S ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174048  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1006  50S ribosomal protein L32  38.18 
 
 		 57 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4144  50S ribosomal protein L32  39.29 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0916  50S ribosomal protein L32  38.18 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1886  50S ribosomal protein L32  66.67 
 
 		 57 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.193978 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0271  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.750719  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1579  50S ribosomal protein L32  39.29 
 
 		 61 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.146664  normal  0.0105145 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3291  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366938 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>