109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_09480 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_09480  50S ribosomal protein L32  100 
 
 		 60 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.145627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5965  50S ribosomal protein L32  81.67 
 
 		 60 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4030  ribosomal protein L32  75.86 
 
 		 59 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1608  50S ribosomal protein L32  63.79 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2274  ribosomal protein L32  63.79 
 
 		 64 aa  75.9  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0211  ribosomal protein L32  68.33 
 
 		 58 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0650  50S ribosomal protein L32  66.67 
 
 		 58 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2781  50S ribosomal protein L32  66.67 
 
 		 59 aa  72.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.147785  normal  0.143209 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11280  LSU ribosomal protein L32P  62.07 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1667  50S ribosomal protein L32  62.07 
 
 		 64 aa  72.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.294477  normal  0.0177766 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1575  50S ribosomal protein L32  63.79 
 
 		 59 aa  71.2  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0654579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1285  50S ribosomal protein L32  62.07 
 
 		 57 aa  70.1  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.761755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1175  50S ribosomal protein L32  62.07 
 
 		 57 aa  70.1  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000516362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1882  ribosomal protein L32  78.95 
 
 		 59 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0381708  normal  0.0158979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3434  ribosomal protein L32  64.91 
 
 		 58 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.976937  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2615  ribosomal protein L32  60 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.499524 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2294  ribosomal protein L32  58.62 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252255  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1137  50S ribosomal protein L32  55.17 
 
 		 56 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131577  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7996  ribosomal protein L32  71.67 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0335  ribosomal protein L32  53.45 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10230  ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000453136  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1040  50S ribosomal protein L32  47.62 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1229  50S ribosomal protein L32  46.55 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037109  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4160  50S ribosomal protein L32  77.42 
 
 		 58 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08890  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4302  50S ribosomal protein L32  82.14 
 
 		 57 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1625a  50S ribosomal protein L32  41.67 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100343  normal  0.018062 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4388  50S ribosomal protein L32  82.14 
 
 		 57 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4682  50S ribosomal protein L32  82.14 
 
 		 57 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.32504 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2805  ribosomal protein L32  45.16 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2502  50S ribosomal protein L32  46.97 
 
 		 67 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.801451  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2240  50S ribosomal protein L32  46.97 
 
 		 67 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000311506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1558  ribosomal protein L32  58.14 
 
 		 56 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0900428  decreased coverage  0.00889428 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1355  LSU ribosomal protein L32P  43.1 
 
 		 57 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130715  normal  0.0921955 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2134  50S ribosomal protein L32  46.55 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000309957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8018  ribosomal protein L32  63.79 
 
 		 57 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1665  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0871064  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4845  50S ribosomal protein L32  75 
 
 		 57 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.784807  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1026  50S ribosomal protein L32P  47.27 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000147931  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3692  ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2559  ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 60 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1006  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 57 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1804  ribosomal protein L32  46.55 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2368  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1886  50S ribosomal protein L32  70 
 
 		 57 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.193978 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0825  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369841  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4414  ribosomal protein L32  59.46 
 
 		 53 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000688865  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1103  ribosomal protein L32  40 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000214959  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0718  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 57 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204019  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1364  ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 59 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000136875  normal  0.339824 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0775  50S ribosomal protein L32  45.76 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000368381  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0798  50S ribosomal protein L32  45.76 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174048  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21540  LSU ribosomal protein L32P  95.45 
 
 		 54 aa  45.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0096297  hitchhiker  0.000173407 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0952  ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000023662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2613  ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1386  ribosomal protein L32  86.96 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3110  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0115825  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1259  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 58 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000760142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1152  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1187  50S ribosomal protein L32  39.29 
 
 		 57 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1209  50S ribosomal protein L32  39.29 
 
 		 57 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000286453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3969  50S ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00129021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3774  50S ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000267221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3665  50S ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.37288e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3682  50S ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000568057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4062  50S ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0386  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0173336  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1859  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898391  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0271  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.750719  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3554  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2573  50S ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000210481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3750  50S ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162679  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3291  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366938 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3976  50S ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4024  50S ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1217  50S ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3938  50S ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1878  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3288  ribosomal protein L32  64.52 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.541236  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0637  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000215733  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0940  ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 63 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000379015  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2988  ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 61 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000138033  normal  0.0167419 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0667  50S ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.728717  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1025  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 62 aa  41.2  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103246  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl396  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 59 aa  41.2  0.004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00156688  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0013  50S ribosomal protein L32  43.64 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0233  50S ribosomal protein L32  42.62 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000487517  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2752  50S ribosomal protein L32  41.67 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1420  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.640468  normal  0.982205 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1975  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.536749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1693  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0657  ribosomal protein L32  45.9 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2844  50S ribosomal protein L32  41.67 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1579  50S ribosomal protein L32  43.33 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.146664  normal  0.0105145 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1904  50S ribosomal protein L32  43.33 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0519443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2936  50S ribosomal protein L32  41.67 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13280  LSU ribosomal protein L32P  61.76 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0352088  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1844  50S ribosomal protein L32  38.98 
 
 		 60 aa  41.2  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000652015  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf408  ribosomal protein L32  38.98 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1786  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.213514  normal  0.442946 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>