18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5221 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5221  hypothetical protein  100 
 
 		 702 aa  1326    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375779  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.11 
 
 		 981 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4029  ATPase-like protein  39.42 
 
 		 758 aa  93.2  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00633058  normal  0.086403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2725  transcriptional regulator, LuxR family  35.95 
 
 		 431 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 1151 aa  67  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1270  LuxR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582862 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0596  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.95 
 
 		 385 aa  56.2  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal  0.0280718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2675  Tetratricopeptide TPR_4  36.81 
 
 		 870 aa  54.7  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00129539  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0446  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 963 aa  53.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00639292 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  33.93 
 
 		 955 aa  50.8  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.72 
 
 		 1146 aa  50.8  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  31.64 
 
 		 922 aa  50.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  44.93 
 
 		 1291 aa  48.5  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  39.74 
 
 		 1226 aa  47.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1298 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  30.3 
 
 		 1160 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  27.03 
 
 		 1143 aa  45.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  28.9 
 
 		 1163 aa  44.3  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>