56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0140 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0140  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
210 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0290  GCN5-related N-acetyltransferase  51.98 
 
 
219 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3258  GCN5-related N-acetyltransferase  51.06 
 
 
226 aa  174  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10817  hypothetical protein  45.63 
 
 
218 aa  169  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00848019  normal  0.721951 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1246  GCN5-related N-acetyltransferase  45.85 
 
 
215 aa  165  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4628  GCN5-related N-acetyltransferase  47.03 
 
 
218 aa  162  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398395  normal  0.333062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5278  GCN5-related N-acetyltransferase  45.02 
 
 
215 aa  161  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.611634  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1175  GCN5-related N-acetyltransferase  43.41 
 
 
214 aa  151  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0544941  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  44.26 
 
 
229 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02140  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  44.39 
 
 
218 aa  148  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.913734  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3064  GCN5-related protein N-acetyltransferase  49.42 
 
 
226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.482932  normal  0.890791 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34800  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  46.78 
 
 
238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4343  GCN5-related N-acetyltransferase  52.1 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028828  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0607  GCN5-related N-acetyltransferase  39.34 
 
 
226 aa  95.9  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.975722  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0364  hypothetical protein  27.56 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.204641 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
198 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18400  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  32.78 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
170 aa  47.8  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.263332  hitchhiker  0.00000000268657 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  26.5 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1206  GCN5-related N-acetyltransferase  22.16 
 
 
178 aa  47  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000216631  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0587  GCN5-related N-acetyltransferase  30.64 
 
 
199 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02170  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  43.4 
 
 
217 aa  47  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4944  GCN5-related N-acetyltransferase  33.66 
 
 
198 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0549264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0153  GCN5-related N-acetyltransferase  32.16 
 
 
199 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531944  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3590  GCN5-related N-acetyltransferase  25.23 
 
 
185 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249758  normal  0.183758 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0155  GCN5-related N-acetyltransferase  36.73 
 
 
199 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.852319  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4036  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 
210 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357695  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1311  GCN5-related N-acetyltransferase  27.71 
 
 
179 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  37.31 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0120  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 
181 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1895  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 
198 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4562  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  26.52 
 
 
172 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.847229 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2812  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 
204 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4642  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0758  GCN5-related N-acetyltransferase  24 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451897  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3685  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.113986  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4372  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000439862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3459  GCN5-related N-acetyltransferase  24.87 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388248  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2524  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 
200 aa  43.9  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.114386 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0441  GCN5-related N-acetyltransferase  31.31 
 
 
202 aa  43.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2197  GCN5-related N-acetyltransferase  29.44 
 
 
184 aa  42.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6199  GCN5-related N-acetyltransferase  26.73 
 
 
173 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30550  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  29.17 
 
 
227 aa  42.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.926933  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0207  acetyltransferase  32.81 
 
 
187 aa  42.4  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.742792  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0680  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 
184 aa  42.4  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000882021  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1415  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
218 aa  42.4  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0692  GCN5-related N-acetyltransferase  27.97 
 
 
210 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0892137 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1891  acetyltransferase  23.08 
 
 
177 aa  42  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2295  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 
175 aa  42  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.4166 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  27.06 
 
 
176 aa  41.6  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0069  acetyltransferase  23.03 
 
 
312 aa  41.6  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1154  hypothetical protein  30.11 
 
 
201 aa  41.6  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0271  GCN5-related N-acetyltransferase  29.89 
 
 
182 aa  41.2  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2743  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
199 aa  41.2  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>