35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_02140 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_02140  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  100 
 
 
218 aa  436  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.913734  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1246  GCN5-related N-acetyltransferase  43.78 
 
 
215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0140  GCN5-related N-acetyltransferase  44.39 
 
 
210 aa  148  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1175  GCN5-related N-acetyltransferase  44 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0544941  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3258  GCN5-related N-acetyltransferase  41.98 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0290  GCN5-related N-acetyltransferase  41.98 
 
 
219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3064  GCN5-related protein N-acetyltransferase  39.67 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.482932  normal  0.890791 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5278  GCN5-related N-acetyltransferase  36.23 
 
 
215 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.611634  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  35.38 
 
 
229 aa  109  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10817  hypothetical protein  38.24 
 
 
218 aa  102  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00848019  normal  0.721951 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34800  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  38.32 
 
 
238 aa  93.2  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4628  GCN5-related N-acetyltransferase  33.66 
 
 
218 aa  89.4  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398395  normal  0.333062 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0607  GCN5-related N-acetyltransferase  43.7 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.975722  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4343  GCN5-related N-acetyltransferase  34.86 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028828  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0069  acetyltransferase  25.36 
 
 
312 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0066  acetyltransferase  26.09 
 
 
194 aa  52  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2197  GCN5-related N-acetyltransferase  31.64 
 
 
184 aa  49.3  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0992  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.36 
 
 
181 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4477  putative acetyltransferase  24.61 
 
 
180 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  unclonable  0.00000138966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21710  hypothetical protein  27.59 
 
 
195 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0824  GCN5-related N-acetyltransferase  27.23 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4320  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.61 
 
 
181 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02170  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  31.9 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3328  GCN5-related N-acetyltransferase  29.87 
 
 
189 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365635  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3526  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140052  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4576  GCN5-related N-acetyltransferase  27.23 
 
 
195 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0441  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
202 aa  43.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4547  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 
176 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.513868  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23870  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  30.37 
 
 
207 aa  42.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1851  hypothetical protein  26.9 
 
 
189 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4797  GCN5-related N-acetyltransferase  25.26 
 
 
195 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0758  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
198 aa  42  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451897  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2709  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 
178 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000725277 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1634  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 
178 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3965  GCN5-related N-acetyltransferase  23.95 
 
 
180 aa  41.6  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>