More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1719 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_1719  hypothetical protein  100 
 
 		 52 aa  102  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.694147 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0279  ribosomal protein L34  82.69 
 
 		 52 aa  87.8  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1543  ribosomal protein L34  84.31 
 
 		 52 aa  84.3  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.185024 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3921  ribosomal protein L34  85.11 
 
 		 55 aa  81.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250811  normal  0.369762 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12828  hypothetical protein  76.47 
 
 		 52 aa  80.5  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0100  50S ribosomal protein L34  76.47 
 
 		 53 aa  79  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0656  50S ribosomal protein L34  82.98 
 
 		 50 aa  77.8  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244963 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  82.98 
 
 		 52 aa  77.4  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3852  ribosomal protein L34  74.51 
 
 		 52 aa  77  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0134  50S ribosomal protein L34  69.23 
 
 		 52 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1055  ribosomal protein L34  74.47 
 
 		 51 aa  70.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2524  ribosomal protein L34  76.6 
 
 		 53 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.480913  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  76.6 
 
 		 47 aa  69.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2763  ribosomal protein L34  77.78 
 
 		 52 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000022911  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  77.27 
 
 		 44 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2132  50S ribosomal protein L34  68.09 
 
 		 53 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189497  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  75.56 
 
 		 46 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2033  50S ribosomal protein L34  68.63 
 
 		 51 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.778923  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  75.56 
 
 		 46 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  77.27 
 
 		 44 aa  65.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5615  ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0446  50S ribosomal protein L34  70.21 
 
 		 51 aa  65.5  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0009  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2743  50S ribosomal protein L34  71.74 
 
 		 53 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4618  50S ribosomal protein L34  73.33 
 
 		 46 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2924  50S ribosomal protein L34  69.57 
 
 		 53 aa  63.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916972  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2338  50S ribosomal protein L34  69.57 
 
 		 53 aa  63.9  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0709  50S ribosomal protein L34  68.09 
 
 		 48 aa  63.2  0.000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf883  ribosomal protein L34  68.09 
 
 		 48 aa  63.2  0.000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2564  50S ribosomal protein L34  63.83 
 
 		 53 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1194  ribosomal protein L34  69.57 
 
 		 57 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000000642694  decreased coverage  0.000208827 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2884  50S ribosomal protein L34  76.74 
 
 		 44 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715219  normal  0.406653 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2147  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  2.00251e-17  unclonable  0.00000111229 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2199  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000155667  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0001  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283755  hitchhiker  0.00000000552795 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0002  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000727123  unclonable  0.0000468434 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2065  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000217746  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2400  50S ribosomal protein L34  65.96 
 
 		 51 aa  61.2  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.84341  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4017  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00224916  normal  0.155192 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4028  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5639  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5320  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5341  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000589989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5185  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5738  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0731881  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5598  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000390368  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5675  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5615  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5281  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3898  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.035137  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2950  ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000318423  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3505  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0561624 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3434  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1540  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000041199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4116  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0205607  normal  0.0561719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4908  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3562  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0220  50S ribosomal protein L34P  68.18 
 
 		 51 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1864  50S ribosomal protein L34P  72.09 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.670126  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2793  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 45 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.202877  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0001  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 45 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000166725  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3336  50S ribosomal protein L34P  69.77 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.754449  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1898  ribosomal protein L34  73.81 
 
 		 54 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000611674  hitchhiker  3.5180100000000004e-26 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2414  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00945499  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1944  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00370795  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2138  ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3034  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3489  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4045  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 46 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2310  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093766 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2632  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2353  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2088  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149936  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1787  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0214193  normal  0.25456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4432  50S ribosomal protein L34  64.44 
 
 		 49 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0357  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  57  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.0448083 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2512  50S ribosomal protein L34  71.43 
 
 		 45 aa  57  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197783  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3089  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1046  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0456047  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3989  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0001  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.549372  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3553  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3400  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.812666  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3101  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038228 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3238  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303962  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0962  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4463  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404373  normal  0.0831526 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0104  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3166  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.667322  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3461  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3760  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>