267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2400 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2400  50S ribosomal protein L34  100 
 
 		 51 aa  98.2  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.84341  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0446  50S ribosomal protein L34  76.47 
 
 		 51 aa  76.6  0.0000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3034  ribosomal protein L34  84.09 
 
 		 44 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3489  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  68.09 
 
 		 47 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3921  ribosomal protein L34  67.35 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250811  normal  0.369762 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf883  ribosomal protein L34  64.58 
 
 		 48 aa  60.5  0.000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2720  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.054761 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1059  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.202626  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0070  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2884  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715219  normal  0.406653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0009  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0081  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5615  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0134  50S ribosomal protein L34  65.96 
 
 		 52 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6059  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0823674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  70.45 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0656  50S ribosomal protein L34  63.83 
 
 		 50 aa  58.2  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244963 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0357  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.0448083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0097  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3505  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0561624 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3545  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0082  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4796  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4143  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5015  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0001  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.549372  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3461  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2138  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0709  50S ribosomal protein L34  62.5 
 
 		 48 aa  57.4  0.00000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3760  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3089  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4908  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4116  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0205607  normal  0.0561719 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  67.44 
 
 		 44 aa  57  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  57  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4487  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849089  hitchhiker  0.00000000110171 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12828  hypothetical protein  63.83 
 
 		 52 aa  56.6  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3463  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00766604  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0279  ribosomal protein L34  63.83 
 
 		 52 aa  56.6  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1540  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000041199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4618  50S ribosomal protein L34  68.89 
 
 		 46 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2763  ribosomal protein L34  64.44 
 
 		 52 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000022911  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0374  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136246  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000390368  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2088  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149936  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0092  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2414  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00945499  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2310  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093766 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4245  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000109099  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  66.67 
 
 		 46 aa  55.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1787  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0214193  normal  0.25456 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1363  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2632  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0872  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 45 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2353  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1194  ribosomal protein L34  60.42 
 
 		 57 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000000642694  decreased coverage  0.000208827 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  66.67 
 
 		 46 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1021  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.797032  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2827  50S ribosomal protein L34P  67.44 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0962  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  59.57 
 
 		 52 aa  55.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0313  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3828  50S ribosomal protein L34P  67.44 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682.1  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2132  50S ribosomal protein L34  61.7 
 
 		 53 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189497  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0301  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4045  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 46 aa  54.7  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486459 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3336  50S ribosomal protein L34P  65.91 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.754449  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4017  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00224916  normal  0.155192 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0551  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3898  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.035137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3553  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0090  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3101  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038228 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3102  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0409092 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3400  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.812666  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3184  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278531 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6523  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3238  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303962  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3989  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4463  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404373  normal  0.0831526 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2552  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941562  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3218  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535057  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3166  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.667322  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3157  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107148 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2243  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.5  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.914999  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0104  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1046  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0456047  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2847  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.565052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2238  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0856  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.5  0.0000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2147  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  2.00251e-17  unclonable  0.00000111229 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0575  50S ribosomal protein L34P  65.91 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5302  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>