28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3551 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3551  protein of unknown function DUF481  100 
 
 
262 aa  518  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3487  hypothetical protein  98.85 
 
 
262 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3404  hypothetical protein  92.89 
 
 
263 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3467  hypothetical protein  62.18 
 
 
264 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0271654 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2051  hypothetical protein  28.09 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000194447  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0792  hypothetical protein  23.31 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.954407  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2309  protein of unknown function DUF481  28.79 
 
 
244 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.070466 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0777  hypothetical protein  26.69 
 
 
245 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0484485  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3246  hypothetical protein  26.69 
 
 
245 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3536  hypothetical protein  27.07 
 
 
245 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3349  hypothetical protein  26.32 
 
 
245 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000236372  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3655  hypothetical protein  26.69 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3461  protein of unknown function DUF481  26.97 
 
 
245 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0831  hypothetical protein  26.97 
 
 
245 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.221265  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0934  hypothetical protein  27.07 
 
 
245 aa  53.5  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1087  hypothetical protein  25.48 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000312385  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0606  hypothetical protein  23.93 
 
 
250 aa  49.7  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3011  hypothetical protein  25 
 
 
243 aa  48.9  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1569  hypothetical protein  22.89 
 
 
251 aa  48.9  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0881  alanine racemase region  22.69 
 
 
356 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.140785  hitchhiker  0.000185996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1948  protein of unknown function DUF481  24.04 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0214186 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0876  hypothetical protein  24.44 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538553  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0370  hypothetical protein  24.59 
 
 
332 aa  45.4  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.397767 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2791  hypothetical protein  23.44 
 
 
245 aa  45.4  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00000611146  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0652  hypothetical protein  24.35 
 
 
246 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000354938  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1079  protein of unknown function DUF481  25.1 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1585  hypothetical protein  22.18 
 
 
242 aa  42.4  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281784  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0668  putative salt-induced outer membrane protein  23.51 
 
 
259 aa  42.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204125  hitchhiker  0.000000158177 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>