84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0668 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0668  putative salt-induced outer membrane protein  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204125  hitchhiker  0.000000158177 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03209  putative orphan protein  42.8 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000209719  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1569  hypothetical protein  39.1 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000191147 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3358  hypothetical protein  41.31 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000013403  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03211  putative salt-induced outer membrane protein  38.02 
 
 		 267 aa  166  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000342266  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0792  hypothetical protein  35.71 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.954407  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3357  putative salt-induced outer membrane protein  37.19 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000088366  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3536  hypothetical protein  35.47 
 
 		 245 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3246  hypothetical protein  35.47 
 
 		 245 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0777  hypothetical protein  35.47 
 
 		 245 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0484485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3655  hypothetical protein  35.85 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3349  hypothetical protein  35.85 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000236372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3461  protein of unknown function DUF481  35.85 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0831  hypothetical protein  35.85 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.221265  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0934  hypothetical protein  35.85 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0652  hypothetical protein  34.46 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000354938  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2051  hypothetical protein  33.58 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000194447  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0876  hypothetical protein  33.96 
 
 		 245 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538553  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1087  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000312385  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2754  hypothetical protein  36.33 
 
 		 247 aa  136  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.716555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0878  hypothetical protein  36.25 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000368102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2791  hypothetical protein  33.2 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00000611146  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3011  hypothetical protein  32.82 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809018  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2309  protein of unknown function DUF481  29.69 
 
 		 244 aa  125  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.070466 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3877  hypothetical protein  30.99 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0756  hypothetical protein  34.08 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.189796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0880  hypothetical protein  34.69 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1079  protein of unknown function DUF481  31.94 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1233  hypothetical protein  31.22 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04136  hypothetical protein  29.58 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.580295  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0606  hypothetical protein  28.62 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3529  protein of unknown function DUF481  27.24 
 
 		 258 aa  89.7  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1257  putative salt-induced outer membrane protein  25.74 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1224  hypothetical protein  25.32 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0878  hypothetical protein  32.02 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.428575  normal  0.136015 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0700  hypothetical protein  25.84 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000147849  hitchhiker  0.000148247 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3360  hypothetical protein  27.82 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.853104  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3223  hypothetical protein  27.82 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1910  hypothetical protein  26.32 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155146  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2440  hypothetical protein  26.32 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.350144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1469  hypothetical protein  26.32 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0334595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1967  hypothetical protein  26.32 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1941  hypothetical protein  26.32 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00616425  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1803  hypothetical protein  26.32 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000450339  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3931  hypothetical protein  25.1 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2017  putative outer membrane protein  26.32 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.277986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3352  hypothetical protein  23.97 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000185649  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1844  putative outer membrane protein  26.32 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476612  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0752  hypothetical protein  23.99 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00298481  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1456  hypothetical protein  26.32 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.273825  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1920  protein of unknown function DUF481  25.88 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302148  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01679  hypothetical protein  25.88 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1424  putative outer membrane protein  26.32 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.284815  decreased coverage  0.000282683 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1441  hypothetical protein  26.32 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0990956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3285  hypothetical protein  23.33 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0505048  hitchhiker  0.000246536 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01691  hypothetical protein  25.88 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0686  hypothetical protein  24.72 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000157748  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3261  hypothetical protein  24.72 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014751  hitchhiker  0.0000121737 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1722  hypothetical protein  28.07 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.346331 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3644  hypothetical protein  24.06 
 
 		 247 aa  72  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000124667  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0731  protein of unknown function DUF481  24.06 
 
 		 247 aa  72  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000132441  hitchhiker  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0740  hypothetical protein  24.06 
 
 		 247 aa  72  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000500329  hitchhiker  0.000136578 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0710  hypothetical protein  23.68 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.410698  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3587  hypothetical protein  26.27 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.204251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4213  hypothetical protein  23.6 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195016  hitchhiker  0.000349999 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0514  hypothetical protein  23.14 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0608195  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2781  hypothetical protein  28.03 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100538  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00019  hypothetical protein  26.86 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0756  hypothetical protein  22.85 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.216313  hitchhiker  0.00000194898 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002336  membrane protein  27.24 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00499723  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0370  hypothetical protein  21.76 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.397767 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3065  putative salt-induced outer membrane protein  22.48 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124339  normal  0.234711 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0046  putative salt-induced outer membrane protein-like  27.65 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.843258  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1733  hypothetical protein  23.63 
 
 		 317 aa  58.5  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0231419  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2903  hypothetical protein  26.38 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00154459  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1948  protein of unknown function DUF481  27.03 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0214186 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3855  hypothetical protein  21.94 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0381  hypothetical protein  25.39 
 
 		 333 aa  52.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.542158  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1585  hypothetical protein  23.66 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281784  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1110  hypothetical protein  23.08 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3551  protein of unknown function DUF481  24.18 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3487  hypothetical protein  24.18 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2054  hypothetical protein  20.25 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1713  Putative salt-induced outer membrane protein-like protein  20.25 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0964751  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>