63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1585 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1585  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  488  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281784  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2791  hypothetical protein  29.63 
 
 		 245 aa  92.4  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00000611146  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2309  protein of unknown function DUF481  28.93 
 
 		 244 aa  92  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.070466 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0370  hypothetical protein  29.11 
 
 		 332 aa  88.2  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.397767 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1079  protein of unknown function DUF481  29.8 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1087  hypothetical protein  30.28 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000312385  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03209  putative orphan protein  25.39 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000209719  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04136  hypothetical protein  26.67 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.580295  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0606  hypothetical protein  26.17 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0792  hypothetical protein  28.96 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.954407  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2051  hypothetical protein  29.91 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000194447  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0652  hypothetical protein  29.76 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000354938  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1733  hypothetical protein  26.15 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0231419  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0934  hypothetical protein  29.55 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1844  putative outer membrane protein  26.36 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476612  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2754  hypothetical protein  32.42 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.716555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3349  hypothetical protein  29.09 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000236372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1424  putative outer membrane protein  27.93 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.284815  decreased coverage  0.000282683 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1456  hypothetical protein  27.93 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.273825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1441  hypothetical protein  27.93 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0990956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0777  hypothetical protein  29.09 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0484485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3246  hypothetical protein  29.09 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3529  protein of unknown function DUF481  24.5 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3461  protein of unknown function DUF481  28 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0831  hypothetical protein  28 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.221265  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1722  hypothetical protein  26.58 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.346331 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2017  putative outer membrane protein  27.48 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.277986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1803  hypothetical protein  25.56 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000450339  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1910  hypothetical protein  25.56 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155146  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1469  hypothetical protein  25.56 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0334595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1967  hypothetical protein  25.56 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2440  hypothetical protein  25.56 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.350144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1941  hypothetical protein  25.56 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00616425  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1920  protein of unknown function DUF481  25.56 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302148  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2347  hypothetical protein  28.04 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01679  hypothetical protein  25.56 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01691  hypothetical protein  25.56 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3655  hypothetical protein  28 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3536  hypothetical protein  28 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3011  hypothetical protein  26.94 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809018  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0756  hypothetical protein  29.32 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.189796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3358  hypothetical protein  27.38 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000013403  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3360  hypothetical protein  28.04 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.853104  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3223  hypothetical protein  28.04 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1569  hypothetical protein  27.45 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000191147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0876  hypothetical protein  28.46 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538553  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2781  hypothetical protein  24.81 
 
 		 269 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100538  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4213  hypothetical protein  26 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195016  hitchhiker  0.000349999 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3855  hypothetical protein  27.65 
 
 		 305 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0878  hypothetical protein  26.92 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.428575  normal  0.136015 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3065  putative salt-induced outer membrane protein  24.5 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124339  normal  0.234711 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0753  Salt-stress induced outer membrane protein  23.28 
 
 		 290 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00019  hypothetical protein  24.17 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1224  hypothetical protein  23.79 
 
 		 269 aa  52.4  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0878  hypothetical protein  28.18 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000368102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1257  putative salt-induced outer membrane protein  23.79 
 
 		 293 aa  52  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2410  hypothetical protein  23.28 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.756599 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002336  membrane protein  23.75 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00499723  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0880  hypothetical protein  28.8 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3357  putative salt-induced outer membrane protein  21.97 
 
 		 268 aa  48.9  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000088366  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0756  hypothetical protein  23.94 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.216313  hitchhiker  0.00000194898 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0424  hypothetical protein  21.55 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.907602  normal  0.0687278 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2903  hypothetical protein  26.82 
 
 		 229 aa  42  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00154459  normal  0.305825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>