90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3461 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0831  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.221265  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3461  protein of unknown function DUF481  100 
 
 
245 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3655  hypothetical protein  99.18 
 
 
245 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3536  hypothetical protein  99.18 
 
 
245 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3349  hypothetical protein  93.88 
 
 
245 aa  476  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000236372  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3246  hypothetical protein  93.47 
 
 
245 aa  474  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0777  hypothetical protein  93.47 
 
 
245 aa  474  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0484485  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0934  hypothetical protein  92.24 
 
 
245 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0876  hypothetical protein  88.98 
 
 
245 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538553  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0652  hypothetical protein  73.98 
 
 
246 aa  377  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000354938  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1087  hypothetical protein  68.18 
 
 
246 aa  353  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000312385  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0792  hypothetical protein  70.73 
 
 
246 aa  346  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.954407  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2754  hypothetical protein  76.21 
 
 
247 aa  341  5.999999999999999e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.716555  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0878  hypothetical protein  71.54 
 
 
246 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000368102  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0756  hypothetical protein  71.14 
 
 
246 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.189796  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0880  hypothetical protein  71.14 
 
 
246 aa  323  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2791  hypothetical protein  35.8 
 
 
245 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00000611146  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3011  hypothetical protein  34.14 
 
 
243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809018  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03209  putative orphan protein  33.46 
 
 
248 aa  132  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000209719  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0668  putative salt-induced outer membrane protein  35.85 
 
 
259 aa  131  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204125  hitchhiker  0.000000158177 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1079  protein of unknown function DUF481  33.33 
 
 
249 aa  128  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1569  hypothetical protein  30.86 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191147 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03211  putative salt-induced outer membrane protein  34.93 
 
 
267 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000342266  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3358  hypothetical protein  33.85 
 
 
245 aa  122  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000013403  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2051  hypothetical protein  33.47 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000194447  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2309  protein of unknown function DUF481  32.11 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.070466 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1233  hypothetical protein  31.48 
 
 
268 aa  113  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3877  hypothetical protein  28.63 
 
 
294 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3357  putative salt-induced outer membrane protein  30 
 
 
268 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000088366  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3352  hypothetical protein  30.56 
 
 
250 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000185649  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0740  hypothetical protein  28.23 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000500329  hitchhiker  0.000136578 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0731  protein of unknown function DUF481  28.23 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000132441  hitchhiker  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3644  hypothetical protein  28.23 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000124667  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0710  hypothetical protein  27.82 
 
 
247 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.410698  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3931  hypothetical protein  28.23 
 
 
247 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0606  hypothetical protein  30.22 
 
 
250 aa  92  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0700  hypothetical protein  28.23 
 
 
251 aa  92  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000147849  hitchhiker  0.000148247 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3065  putative salt-induced outer membrane protein  29.27 
 
 
248 aa  90.5  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124339  normal  0.234711 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0752  hypothetical protein  26.21 
 
 
247 aa  90.1  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00298481  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3261  hypothetical protein  26.89 
 
 
251 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014751  hitchhiker  0.0000121737 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0686  hypothetical protein  26.89 
 
 
251 aa  89.4  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000157748  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3587  hypothetical protein  28.23 
 
 
247 aa  88.6  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.204251  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3529  protein of unknown function DUF481  27.59 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0370  hypothetical protein  25.91 
 
 
332 aa  87.4  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.397767 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3285  hypothetical protein  26.09 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0505048  hitchhiker  0.000246536 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0878  hypothetical protein  31.22 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.428575  normal  0.136015 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3855  hypothetical protein  27.19 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248641  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3223  hypothetical protein  29.06 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3360  hypothetical protein  29.06 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.853104  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4213  hypothetical protein  27.94 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195016  hitchhiker  0.000349999 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0756  hypothetical protein  26.64 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.216313  hitchhiker  0.00000194898 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1733  hypothetical protein  28.25 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0231419  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04136  hypothetical protein  25.9 
 
 
256 aa  77  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.580295  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0514  hypothetical protein  26.95 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0608195  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1224  hypothetical protein  24.11 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1722  hypothetical protein  26.13 
 
 
289 aa  63.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.346331 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1585  hypothetical protein  28 
 
 
242 aa  63.2  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281784  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1257  putative salt-induced outer membrane protein  23.72 
 
 
293 aa  62.8  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1967  hypothetical protein  26.2 
 
 
252 aa  62  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2440  hypothetical protein  26.2 
 
 
252 aa  62  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.350144  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1803  hypothetical protein  26.2 
 
 
252 aa  62  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000450339  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1910  hypothetical protein  26.2 
 
 
252 aa  62  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155146  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1469  hypothetical protein  26.2 
 
 
252 aa  62  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0334595  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1941  hypothetical protein  26.2 
 
 
252 aa  62  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00616425  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1424  putative outer membrane protein  26.79 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.284815  decreased coverage  0.000282683 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1456  hypothetical protein  26.79 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.273825  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1441  hypothetical protein  26.79 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0990956  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1920  protein of unknown function DUF481  25.76 
 
 
252 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302148  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01679  hypothetical protein  25.76 
 
 
252 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01691  hypothetical protein  25.76 
 
 
252 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2903  hypothetical protein  27.4 
 
 
229 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00154459  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2017  putative outer membrane protein  26.79 
 
 
241 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.277986  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1844  putative outer membrane protein  26.34 
 
 
241 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476612  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002336  membrane protein  26.99 
 
 
254 aa  58.5  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00499723  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1713  Putative salt-induced outer membrane protein-like protein  23.68 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0964751  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2054  hypothetical protein  23.68 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0381  hypothetical protein  26.81 
 
 
333 aa  53.1  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.542158  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1484  hypothetical protein  27.27 
 
 
377 aa  52.8  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2781  hypothetical protein  25.76 
 
 
269 aa  52.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100538  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00019  hypothetical protein  26.41 
 
 
254 aa  50.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1110  hypothetical protein  29.03 
 
 
249 aa  49.7  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3487  hypothetical protein  25.93 
 
 
262 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3404  hypothetical protein  25.21 
 
 
263 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3551  protein of unknown function DUF481  25.51 
 
 
262 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1948  protein of unknown function DUF481  23.11 
 
 
302 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0214186 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1952  hypothetical protein  43.4 
 
 
348 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.440982  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0046  putative salt-induced outer membrane protein-like  24 
 
 
268 aa  42.7  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.843258  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1695  hypothetical protein  24.26 
 
 
372 aa  42.4  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0466437  normal  0.4306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2347  hypothetical protein  20.77 
 
 
333 aa  42.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3467  hypothetical protein  23.31 
 
 
264 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0271654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>