26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3404 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3404  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3551  protein of unknown function DUF481  92.95 
 
 
262 aa  448  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3487  hypothetical protein  92.53 
 
 
262 aa  444  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3467  hypothetical protein  63.03 
 
 
264 aa  300  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0271654 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2051  hypothetical protein  29.43 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000194447  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0792  hypothetical protein  24.17 
 
 
246 aa  62.8  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.954407  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3655  hypothetical protein  25.56 
 
 
245 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0777  hypothetical protein  24.81 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0484485  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3246  hypothetical protein  24.81 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3536  hypothetical protein  25.94 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2309  protein of unknown function DUF481  28.74 
 
 
244 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.070466 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0652  hypothetical protein  24.72 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000354938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0831  hypothetical protein  25.84 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.221265  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3461  protein of unknown function DUF481  25.84 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3349  hypothetical protein  24.81 
 
 
245 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000236372  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1087  hypothetical protein  25.38 
 
 
246 aa  57  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000312385  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0876  hypothetical protein  24.06 
 
 
245 aa  55.5  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538553  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0934  hypothetical protein  25.56 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0881  alanine racemase region  24.54 
 
 
356 aa  52.4  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.140785  hitchhiker  0.000185996 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1079  protein of unknown function DUF481  26.34 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3358  hypothetical protein  23.19 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000013403  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1569  hypothetical protein  22.05 
 
 
251 aa  47  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191147 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3011  hypothetical protein  22.83 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809018  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0606  hypothetical protein  22.4 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0370  hypothetical protein  25.41 
 
 
332 aa  42.7  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.397767 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1585  hypothetical protein  23.97 
 
 
242 aa  42  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>