53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene pE33L466_0043 on replicon NC_007103
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  84.88 
 
 
1479 bp  726    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  89.22 
 
 
1479 bp  1057    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  90.39 
 
 
1464 bp  1144    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  90.82 
 
 
1479 bp  1176    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  90.82 
 
 
1482 bp  1176    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  91.36 
 
 
1479 bp  1215    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  90.93 
 
 
1482 bp  1183    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  90.72 
 
 
1479 bp  1168    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  90.93 
 
 
1482 bp  1183    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0043    100 
 
 
1360 bp  2696    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  90.82 
 
 
1479 bp  1176    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  90.93 
 
 
1479 bp  1183    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  89.33 
 
 
1479 bp  85.7  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  84.76 
 
 
1467 bp  81.8  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  88 
 
 
1479 bp  77.8  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  88 
 
 
1479 bp  77.8  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  100 
 
 
1536 bp  73.8  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  91.23 
 
 
1455 bp  73.8  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  91.07 
 
 
1479 bp  71.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  91.07 
 
 
1479 bp  71.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  91.07 
 
 
1479 bp  71.9  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  91.07 
 
 
1479 bp  71.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  86.67 
 
 
1479 bp  69.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  89.29 
 
 
1479 bp  63.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  89.29 
 
 
1479 bp  63.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  90.91 
 
 
1470 bp  56  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  86.44 
 
 
1497 bp  54  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1200  sodium/proline symporter  85.48 
 
 
1509 bp  52  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133838  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  100 
 
 
1500 bp  52  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1085  sodium/proline symporter  85.48 
 
 
1512 bp  52  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1190  sodium/proline symporter  85.48 
 
 
1509 bp  52  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.969329  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1235  sodium/proline symporter  85.48 
 
 
1509 bp  52  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0211084  normal  0.60164 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1220  sodium/proline symporter  85.48 
 
 
1509 bp  52  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0149  Sodium/proline symporter  89.13 
 
 
1497 bp  52  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0764  sodium/proline symporter  88 
 
 
1497 bp  52  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4236  sodium/proline symporter  88 
 
 
1497 bp  52  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4423  sodium/proline symporter  88 
 
 
1497 bp  52  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  96.67 
 
 
1488 bp  52  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  90.74 
 
 
1452 bp  52  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3940  sodium/proline symporter  94.12 
 
 
1497 bp  52  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4283  sodium/proline symporter  88 
 
 
1497 bp  52  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0117  sodium/proline symporter  88 
 
 
1497 bp  52  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  85.96 
 
 
1536 bp  50.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3097.4  sodium/proline symporter  89.47 
 
 
741 bp  50.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  93.94 
 
 
1494 bp  50.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0492  sodium/proline symporter  85.96 
 
 
1497 bp  50.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2367  sodium/proline symporter  88.64 
 
 
1485 bp  48.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0234397  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2039  proline permease  88.64 
 
 
1485 bp  48.1  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2265  sodium/proline symporter  88.64 
 
 
1485 bp  48.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  91.67 
 
 
1539 bp  48.1  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  91.67 
 
 
1539 bp  48.1  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0083  sodium/proline symporter  93.75 
 
 
1497 bp  48.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4055  sodium/proline symporter  86.54 
 
 
1497 bp  48.1  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>