21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1835 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1835  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  264  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1832  hypothetical protein  99.23 
 
 
130 aa  263  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1464  hypothetical protein  30.89 
 
 
125 aa  60.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0862  putative transmembrane protein  28.33 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0133398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1006  putative transmembrane protein  28.33 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0490941 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1474  hypothetical protein  28.57 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415713  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4750  hypothetical protein  27.64 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54340  hypothetical protein  27.64 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1389  hypothetical protein  29.03 
 
 
126 aa  54.3  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.686491  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2028  transmembrane protein  31.93 
 
 
116 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269363  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2976  hypothetical protein  28.33 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00305374  hitchhiker  0.00646242 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01716  hypothetical protein  29.17 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.62979  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2459  hypothetical protein  27.42 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1091  hypothetical protein  23.77 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0652611  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1346  hypothetical protein  21.85 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.325853  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2313  hypothetical protein  29.27 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.303792  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2087  transmembrane protein  25.64 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1443  hypothetical protein  24.58 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.969465  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1374  hypothetical protein  24.58 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0599  hypothetical protein  37.21 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000903433 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4218  hypothetical protein  21.77 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0331005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>