29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2018 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2023  hypothetical protein  99.05 
 
 
315 aa  647    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2018  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  653    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1389  GHMP kinase  32.74 
 
 
368 aa  132  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385425  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04605  hypothetical protein  31.27 
 
 
360 aa  130  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0497  GHMP kinase  32.15 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000421791  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1734  diphosphomevalonate decarboxylase  31.13 
 
 
332 aa  113  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1612  diphosphomevalonate decarboxylase  31.21 
 
 
334 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1034  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  34 
 
 
321 aa  103  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04414  diphosphomevalonate decarboxylase (AFU_orthologue; AFUA_4G07130)  30.06 
 
 
404 aa  102  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00225214  normal  0.629565 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0783  diphosphomevalonate decarboxylase  29.1 
 
 
325 aa  102  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.424746  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1101  diphosphomevalonate decarboxylase  32.89 
 
 
314 aa  101  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.183579  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0720  diphosphomevalonate decarboxylase/isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.58 
 
 
503 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0013091  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0619  diphosphomevalonate decarboxylase  29.58 
 
 
503 aa  100  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0455  diphosphomevalonate decarboxylase  29.01 
 
 
318 aa  94  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1123  diphosphomevalonate decarboxylase  29.51 
 
 
295 aa  93.2  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1325  diphosphomevalonate decarboxylase  32.47 
 
 
314 aa  92.8  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0239  mevalonate diphosphate decarboxylase  30.23 
 
 
327 aa  92  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04950  diphosphomevalonate decarboxylase, putative  29.94 
 
 
395 aa  91.7  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0629  mevalonate diphosphate decarboxylase  32 
 
 
327 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0614  mevalonate diphosphate decarboxylase  32 
 
 
327 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1386  diphosphomevalonate decarboxylase  32.9 
 
 
313 aa  91.7  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90752  predicted protein  28.98 
 
 
387 aa  87.4  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0706  diphosphomevalonate decarboxylase  28.14 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0914  diphosphomevalonate decarboxylase  28.29 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000162632  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0599  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  32.57 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0313  diphosphomevalonate decarboxylase  29.64 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0381784 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1576  diphosphomevalonate decarboxylase  27.39 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00467699 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0691  diphosphomevalonate decarboxylase  23.62 
 
 
323 aa  46.6  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3408  diphosphomevalonate decarboxylase  28.57 
 
 
337 aa  46.2  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0207925  normal  0.138111 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>