More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2019 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2019  fructose-6-phosphate aldolase  100 
 
 		 221 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474046  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2241  fructose-6-phosphate aldolase  99.55 
 
 		 242 aa  441  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.605165  normal  0.0639898 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1908  fructose-6-phosphate aldolase  100 
 
 		 221 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000869598  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2640  fructose-6-phosphate aldolase  79.19 
 
 		 221 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305368 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1319  fructose-6-phosphate aldolase  72.48 
 
 		 220 aa  318  5e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.144476  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2817  transaldolase  69.27 
 
 		 220 aa  308  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112444  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4357  fructose-6-phosphate aldolase  65.91 
 
 		 220 aa  307  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4515  fructose-6-phosphate aldolase  65.91 
 
 		 220 aa  307  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281693 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4441  fructose-6-phosphate aldolase  65.91 
 
 		 220 aa  307  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.933365 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0975  fructose-6-phosphate aldolase  68.81 
 
 		 220 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4326  fructose-6-phosphate aldolase  65.45 
 
 		 220 aa  305  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4444  fructose-6-phosphate aldolase  65.45 
 
 		 220 aa  305  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701995 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0850  fructose-6-phosphate aldolase  67.89 
 
 		 220 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0896  fructose-6-phosphate aldolase  68.81 
 
 		 220 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00792  fructose-6-phosphate aldolase 1  68.35 
 
 		 220 aa  302  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00809  hypothetical protein  68.35 
 
 		 220 aa  302  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0883  fructose-6-phosphate aldolase  68.35 
 
 		 220 aa  302  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2819  fructose-6-phosphate aldolase  68.35 
 
 		 220 aa  302  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2523  fructose-6-phosphate aldolase  68.35 
 
 		 220 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.310878  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03832  fructose-6-phosphate aldolase 2  65.91 
 
 		 220 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4486  fructose-6-phosphate aldolase  65.91 
 
 		 220 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4181  fructose-6-phosphate aldolase  65.91 
 
 		 220 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03781  hypothetical protein  65.91 
 
 		 220 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4394  fructose-6-phosphate aldolase  65.91 
 
 		 220 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4069  fructose-6-phosphate aldolase  65.91 
 
 		 220 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4039  transaldolase  65.91 
 
 		 220 aa  288  6e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4433  fructose-6-phosphate aldolase  65 
 
 		 220 aa  286  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5407  fructose-6-phosphate aldolase  65.45 
 
 		 220 aa  285  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3551  fructose-6-phosphate aldolase  60.65 
 
 		 221 aa  280  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001154  transaldolase  50.68 
 
 		 224 aa  215  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000861143  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0092  Transaldolase  41.18 
 
 		 222 aa  171  7.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1068  Transaldolase  39.27 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000767665  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0332  fructose-6-phosphate aldolase  37.04 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2783  transaldolase  39.15 
 
 		 215 aa  154  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1939  Transaldolase  36.99 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682854  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0683  putative translaldolase  35.65 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0684  putative translaldolase  35.65 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0013  transaldolase  35.19 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2877  transaldolase  37.74 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000016267  hitchhiker  0.00000329415 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1110  putative translaldolase  35.98 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0553  putative translaldolase  36.32 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0285  putative translaldolase  36.32 
 
 		 215 aa  148  7e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0057  transaldolase  39.34 
 
 		 218 aa  148  8e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0624  putative translaldolase  35.85 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.04318e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0610  putative translaldolase  35.38 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0618  putative translaldolase  35.85 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.911017  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21800  putative transaldolase  37.56 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0705  putative translaldolase  35.85 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.931259  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4411  putative transaldolase  36.79 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1366  putative translaldolase  36.32 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.705012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0738  putative translaldolase  33.49 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0637  putative translaldolase  33.49 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0581  putative translaldolase  33.49 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0580  putative translaldolase  33.49 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0670  putative translaldolase  33.49 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0907799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0727  putative translaldolase  33.49 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53489e-39 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2410  transaldolase  36.28 
 
 		 213 aa  144  9e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00815052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0702  putative translaldolase  33.49 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0278  putative translaldolase  35.38 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.415561  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1619  putative translaldolase  36.79 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4838  transaldolase  36.79 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000777517  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1617  putative translaldolase  33.02 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.68497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03280  putative transaldolase  35.48 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0309181  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3442  putative translaldolase  33.49 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2037  transaldolase  38.21 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000238451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0373  putative translaldolase  35.85 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4636  putative translaldolase  33.02 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0957059  unclonable  2.60878e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3332  putative translaldolase  33.02 
 
 		 213 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0799  putative translaldolase  33.02 
 
 		 215 aa  141  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000767356  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0565  putative translaldolase  33.8 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000239698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0584  putative translaldolase  32.55 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0497  putative translaldolase  35.38 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1809  putative translaldolase  33.49 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0294  putative translaldolase  34.91 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1864  transaldolase  35.21 
 
 		 226 aa  138  7.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1070  putative translaldolase  35.85 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.144646  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1777  transaldolase  32.86 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1102  putative translaldolase  36.97 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.150753  hitchhiker  0.00417913 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0815  putative translaldolase  33.49 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0636  putative translaldolase  34.43 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0058  transaldolase  37.26 
 
 		 219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0401075  hitchhiker  0.00104949 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4909  putative translaldolase  34.74 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1479  transaldolase  32.87 
 
 		 217 aa  135  5e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1229  putative translaldolase  33.02 
 
 		 217 aa  134  8e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0230  putative translaldolase  34.72 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3175  putative transaldolase  35.07 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000196987  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0617  putative translaldolase  33.49 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000452349  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0364  putative translaldolase  37.74 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0396985  normal  0.678872 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4615  putative transaldolase  36.11 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.463616 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1161  putative translaldolase  33.02 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1147  putative transaldolase  34.91 
 
 		 217 aa  134  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.143358  normal  0.104107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0417  putative transaldolase  35.19 
 
 		 217 aa  133  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.67449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2486  putative transaldolase  34.11 
 
 		 214 aa  133  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2977  putative translaldolase  33.02 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.324896  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0636  transaldolase  34.11 
 
 		 217 aa  131  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0551  putative translaldolase  34.58 
 
 		 213 aa  131  7.999999999999999e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.195885  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0473  transaldolase  35.21 
 
 		 223 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4211  putative translaldolase  36.32 
 
 		 217 aa  131  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4063  putative translaldolase  36.32 
 
 		 217 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.379343  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4186  putative translaldolase  35.85 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>