More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0200 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1521  glucose-6-phosphate isomerase  73.2 
 
 		 504 aa  714    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0200  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 502 aa  1022    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.525891  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00687  glucose-6-phosphate isomerase  79.4 
 
 		 504 aa  809    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0176  glucose-6-phosphate isomerase  98.61 
 
 		 502 aa  1011    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  42.48 
 
 		 549 aa  412  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2119  Glucose-6-phosphate isomerase  45.91 
 
 		 552 aa  415  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0430441 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  42.28 
 
 		 547 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  42.61 
 
 		 560 aa  398  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  41.86 
 
 		 548 aa  393  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  42.48 
 
 		 540 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  41.7 
 
 		 548 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  42.11 
 
 		 556 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  42.88 
 
 		 541 aa  388  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  41.51 
 
 		 548 aa  385  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  40.75 
 
 		 562 aa  387  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  42.64 
 
 		 556 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  42.64 
 
 		 556 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  41.04 
 
 		 559 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  42.26 
 
 		 540 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  42.26 
 
 		 540 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  42.26 
 
 		 540 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  42.26 
 
 		 540 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  42.26 
 
 		 540 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  41.71 
 
 		 547 aa  383  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  42.11 
 
 		 540 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  42.26 
 
 		 540 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2308  glucose-6-phosphate isomerase  42.08 
 
 		 540 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764178  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  40.66 
 
 		 545 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  42.11 
 
 		 556 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  43.54 
 
 		 540 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  42.75 
 
 		 540 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  42.23 
 
 		 615 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  41.7 
 
 		 551 aa  380  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  42.41 
 
 		 547 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  41.56 
 
 		 548 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1357  glucose-6-phosphate isomerase  42.71 
 
 		 540 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553854  normal  0.605631 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1279  glucose-6-phosphate isomerase  41.12 
 
 		 545 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000145573  normal  0.0332252 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  40 
 
 		 549 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  40.11 
 
 		 552 aa  377  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0665  glucose-6-phosphate isomerase  41.62 
 
 		 553 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3594  glucose-6-phosphate isomerase  39.81 
 
 		 554 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  40.04 
 
 		 545 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  39.77 
 
 		 545 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0581  glucose-6-phosphate isomerase  41.59 
 
 		 526 aa  373  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  39.77 
 
 		 545 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  39.77 
 
 		 545 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  40.36 
 
 		 531 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2287  glucose-6-phosphate isomerase  42.83 
 
 		 540 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384563  normal  0.236333 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  39.58 
 
 		 545 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  38.43 
 
 		 548 aa  375  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0912  glucose-6-phosphate isomerase  39.81 
 
 		 545 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  38.85 
 
 		 548 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03322  glucose-6-phosphate isomerase  38.94 
 
 		 549 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  38.49 
 
 		 539 aa  371  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  38.85 
 
 		 548 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  43.53 
 
 		 549 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1006  glucose-6-phosphate isomerase  40.7 
 
 		 547 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.777587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  40.68 
 
 		 541 aa  372  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  38.85 
 
 		 548 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1808  glucose-6-phosphate isomerase  40.89 
 
 		 554 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.339602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4700  glucose-6-phosphate isomerase  40.89 
 
 		 554 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0570543  hitchhiker  0.00570528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  39.58 
 
 		 547 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  38.99 
 
 		 548 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  40.08 
 
 		 550 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  39.93 
 
 		 550 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1088  glucose-6-phosphate isomerase  38.98 
 
 		 545 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000310593  normal  0.0429778 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0045  glucose-6-phosphate isomerase  41.76 
 
 		 556 aa  368  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0732  glucose-6-phosphate isomerase  40.52 
 
 		 554 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309434  hitchhiker  0.0000815529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  38.73 
 
 		 552 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  40.8 
 
 		 545 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1682  glucose-6-phosphate isomerase  41.51 
 
 		 534 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419793  normal  0.180807 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1184  glucose-6-phosphate isomerase  40.4 
 
 		 545 aa  365  1e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00253768  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  39.73 
 
 		 545 aa  364  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4566  glucose-6-phosphate isomerase  40.52 
 
 		 554 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489818  normal  0.0824899 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  37.92 
 
 		 545 aa  364  2e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  37.92 
 
 		 549 aa  364  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4701  glucose-6-phosphate isomerase  40.52 
 
 		 554 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101931 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  37.92 
 
 		 549 aa  363  4e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4813  glucose-6-phosphate isomerase  40.3 
 
 		 554 aa  362  6e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  39.18 
 
 		 549 aa  363  6e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  39.85 
 
 		 545 aa  362  6e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0932  glucose-6-phosphate isomerase  41.96 
 
 		 548 aa  362  8e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0922928  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  41.04 
 
 		 546 aa  362  9e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  40.35 
 
 		 550 aa  362  1e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  39.81 
 
 		 550 aa  361  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1859  Glucose-6-phosphate isomerase  41.92 
 
 		 549 aa  361  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77335 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  41 
 
 		 649 aa  361  2e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  39.65 
 
 		 545 aa  361  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  39.23 
 
 		 550 aa  361  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1267  glucose-6-phosphate isomerase  36.77 
 
 		 547 aa  360  4e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2735  glucose-6-phosphate isomerase  39.11 
 
 		 545 aa  360  4e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000381745  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  38.49 
 
 		 567 aa  360  4e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0118  glucose-6-phosphate isomerase  39.24 
 
 		 555 aa  360  5e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1250  glucose-6-phosphate isomerase  43.98 
 
 		 547 aa  359  6e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1020  glucose-6-phosphate isomerase  38.36 
 
 		 546 aa  359  6e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5598  glucose-6-phosphate isomerase  44.16 
 
 		 520 aa  358  8e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.885182  normal  0.434558 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  39.19 
 
 		 550 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  38.52 
 
 		 549 aa  358  9.999999999999999e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  42.4 
 
 		 549 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4877  glucose-6-phosphate isomerase  42.27 
 
 		 553 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.872303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>