35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0006 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0006  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  438  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0006  abortive infection protein  98.65 
 
 		 276 aa  436  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0005  Abortive infection protein  53.2 
 
 		 281 aa  202  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0159968 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03479  caax amino terminal protease family  50.69 
 
 		 278 aa  202  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  32.8 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1838  metal-dependent membrane protease  36.8 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0506649  normal  0.0616534 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0542  metal-dependent membrane protease  36.17 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.67642  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  33.65 
 
 		 321 aa  49.3  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  33.11 
 
 		 279 aa  48.5  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2572  Abortive infection protein  27.46 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610355  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0659  abortive infection protein  35.9 
 
 		 328 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1829  metal-dependent membrane protease  32.73 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000168416  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2783  Abortive infection protein  36.26 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  0.142133 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0172  protease, putative  29.73 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  26.9 
 
 		 297 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4524  abortive infection protein  34.78 
 
 		 285 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.516167 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  27.48 
 
 		 292 aa  46.6  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  30.11 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  24.86 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  35.85 
 
 		 321 aa  45.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  28.4 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1867  abortive infection protein  30.28 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1832  abortive infection protein  30.28 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  35.96 
 
 		 420 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  28.17 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  26.48 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  33.64 
 
 		 333 aa  43.5  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  35.48 
 
 		 308 aa  42.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  32.98 
 
 		 279 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  24.58 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  29.09 
 
 		 319 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1471  hypothetical protein  34.95 
 
 		 311 aa  42.4  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  31.58 
 
 		 235 aa  41.6  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1494  abortive infection protein  46.43 
 
 		 326 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.81139 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1092  abortive infection protein  38 
 
 		 284 aa  41.6  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>