19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2665 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2665  glycoside hydrolase family 35  100 
 
 		 534 aa  1081    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4843  mannonate dehydratase  49.06 
 
 		 925 aa  505  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0781213  hitchhiker  0.00115783 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2959  glycoside hydrolase family 42 protein  47.47 
 
 		 571 aa  457  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1339  hypothetical protein  40.91 
 
 		 571 aa  375  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.946063  normal  0.357882 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3530  glycoside hydrolase family 35  38.35 
 
 		 546 aa  299  7e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0694576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1291  glycoside hydrolase family protein  35.09 
 
 		 554 aa  280  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186796  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2501  DNA recombination protein, RuvA  34.47 
 
 		 569 aa  278  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00226374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2520  glycoside hydrolase family 35  43.59 
 
 		 534 aa  256  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02804  beta-galactosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00670)  39.3 
 
 		 466 aa  172  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.409324  normal  0.343793 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2925  Beta-galactosidase  29.89 
 
 		 799 aa  57.4  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  24.88 
 
 		 780 aa  57  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  26.32 
 
 		 613 aa  57  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  26.9 
 
 		 612 aa  54.3  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2009  Beta-galactosidase  26.32 
 
 		 612 aa  53.9  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237647  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37160  beta-galactosidase  29.56 
 
 		 832 aa  50.8  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5411  Beta-galactosidase  26.01 
 
 		 586 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42814  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5220  hypothetical protein  34.92 
 
 		 723 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.840911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2151  Beta-galactosidase  29.72 
 
 		 685 aa  45.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.355264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.5 
 
 		 1001 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>