22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2539 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2539  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1140  transcriptional regulator, TetR family  46.04 
 
 		 242 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00144314 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1257  regulatory protein TetR  45.08 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0471441 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0882  regulatory protein TetR  44.62 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4062  TetR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3768  TetR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1361  regulatory protein TetR  43.59 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.560408  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4023  putative transcriptional regulator, TetR family  42.64 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332964  normal  0.373488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4945  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 283 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000126171 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2266  regulatory protein TetR  40 
 
 		 204 aa  118  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6153  regulatory protein TetR  36.65 
 
 		 199 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0154  hypothetical protein  37.57 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1098  hypothetical protein  33.82 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3282  hypothetical protein  37.09 
 
 		 214 aa  97.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0678  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2820  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 213 aa  62  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1779  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.787472  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1141  hypothetical protein  23.4 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1136  hypothetical protein  23.4 
 
 		 203 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 192 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 189 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 205 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>