26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2298 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2298  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 616 aa  1216    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.130314 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  29.1 
 
 		 606 aa  170  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5105  hypothetical protein  29.28 
 
 		 603 aa  170  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5186  hypothetical protein  26.84 
 
 		 584 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.510338  normal  0.40998 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4033  hypothetical protein  28.48 
 
 		 596 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6958  hypothetical protein  28.67 
 
 		 600 aa  164  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4881  hypothetical protein  29.52 
 
 		 605 aa  163  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59857  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4048  hypothetical protein  35.25 
 
 		 318 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5145  hypothetical protein  29.89 
 
 		 569 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4047  hypothetical protein  47.73 
 
 		 602 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5936  TPR repeat-containing protein  55.24 
 
 		 239 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0246268  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5239  TPR repeat-containing protein  55.34 
 
 		 219 aa  105  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3240  hypothetical protein  50.38 
 
 		 188 aa  103  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.787646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1984  hypothetical protein  42.54 
 
 		 368 aa  97.4  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4455  hypothetical protein  50 
 
 		 191 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1109  putative PAS/PAC sensor protein  45.3 
 
 		 375 aa  91.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1212  hypothetical protein  39.73 
 
 		 274 aa  91.7  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1098  hypothetical protein  39.47 
 
 		 595 aa  88.2  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1711  hypothetical protein  36.48 
 
 		 414 aa  87.4  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99847  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0279  tetratricopeptide TPR_4  26.75 
 
 		 581 aa  81.6  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.262775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2138  putative PAS/PAC sensor protein  48.81 
 
 		 386 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0223192  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5072  hypothetical protein  35.19 
 
 		 594 aa  68.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0706  transcriptional regulator, CadC  25.67 
 
 		 479 aa  46.6  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303496  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.41 
 
 		 596 aa  45.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 		 578 aa  45.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 878 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>