157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1303 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD1303  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  100 
 
 
135 aa  277  3e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.116648  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0796  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  53.01 
 
 
138 aa  91.7  4e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0280  RNA polymerase, omega subunit  53.01 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0530  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  50 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0110706  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02820  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.77 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4389  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45.16 
 
 
87 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.100298 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3393  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.24 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3521  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.24 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18853  normal  0.192776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70450  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45.16 
 
 
88 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3528  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.85 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.408605  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6113  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45.16 
 
 
88 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33063  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3197  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.24 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.114465  normal  0.694875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0030  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.97 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal  0.0218985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0032  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.97 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195903  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2326  RNA polymerase, omega subunit  50 
 
 
69 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000968364  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5550  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  43.86 
 
 
87 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1895  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.24 
 
 
136 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000285128 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0718  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.34 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.485199  hitchhiker  0.000000920527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0074  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  41.94 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0210  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  41.94 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1857  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.91 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0490453  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3590  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  47.54 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3731  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  47.54 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3657  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  47.54 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.284289  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0252  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.39 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00381696  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0564  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.34 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0377  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.25 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648225  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5301  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45.61 
 
 
87 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337181  normal  0.206293 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1576  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.44 
 
 
123 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.229817  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5349  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45.61 
 
 
87 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0172  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45.61 
 
 
87 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.840834  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5210  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45.61 
 
 
87 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.715758  normal  0.333342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2867  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.5 
 
 
141 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.934104  normal  0.0189372 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3837  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.66 
 
 
129 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3161  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  45.16 
 
 
69 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000980407  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0576  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  44.26 
 
 
86 aa  51.2  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.064194  normal  0.105379 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2967  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.71 
 
 
130 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183581  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1145  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.97 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0992  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.97 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.310133  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2646  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.97 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.192683  normal  0.0194181 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1602  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.33 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.175308 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0635  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40.3 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1441  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.71 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2607  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.97 
 
 
130 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00298684  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0999  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.97 
 
 
129 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00888073 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4385  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  45.61 
 
 
74 aa  50.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2634  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.71 
 
 
130 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23682  normal  0.434333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2446  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.42 
 
 
131 aa  50.4  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2256  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.44 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.366535  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0676  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  43.94 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3711  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  46.88 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2237  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  44.12 
 
 
69 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0513  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.03 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3212  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  45.9 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000144072  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3259  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.71 
 
 
99 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.546002  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2566  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.11 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000389838  unclonable  0.0000000322827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4688  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.44 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.195619 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0644  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.44 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1727  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.85 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.121301 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1923  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  34.18 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0755  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.5 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3234  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.71 
 
 
83 aa  48.9  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.665488  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4972  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.29 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1669  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.11 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0141  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.98 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0945  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.44 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4018  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40 
 
 
71 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.506411  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0302  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.11 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.445694  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1051  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  44.26 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000307419 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0193  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.11 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1991  RNA polymerase omega subunit  38.6 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1986  RNA polymerase omega subunit  38.6 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1724  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.7 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.624474 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2004  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.7 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.159154 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1401  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.11 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0891188 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2637  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  34.18 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0651  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  34.18 
 
 
133 aa  47.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.517828  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0842  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.5 
 
 
98 aa  47.8  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0467  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.44 
 
 
132 aa  47.8  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0571588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2285  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  43.1 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1213  RNA polymerase, omega subunit  40.32 
 
 
86 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.492791  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2577  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.35 
 
 
117 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611684 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1779  DNA-directed RNA polymerase omega chain  41.38 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00826217  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0408  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  41.38 
 
 
97 aa  47  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.103072  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2022  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  46.55 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0034  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  33.87 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3844  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.07 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2143  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  35.29 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2400  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40.98 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0782645  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4493  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.71 
 
 
91 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5436  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.88 
 
 
80 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4210  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.71 
 
 
91 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4219  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.88 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0970  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.24 
 
 
123 aa  44.7  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.528161  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3084  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.88 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.590238  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4108  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.88 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00419927  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0051  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.33 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0139624  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1587  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.88 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00788426  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0521  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.88 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1000  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.88 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>