More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4183 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2774  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  59.81 
 
 		 538 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0113  carboxyl transferase  60.67 
 
 		 539 aa  644    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.495482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4463  propionyl-CoA carboxylase  61.85 
 
 		 551 aa  668    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1149  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  60 
 
 		 538 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2413  propionyl-CoA carboxylase  62.78 
 
 		 537 aa  669    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.193617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1721  carboxyl transferase  61.85 
 
 		 539 aa  652    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2929  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  60.19 
 
 		 538 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4183  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 553 aa  1124    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0106  carboxyl transferase  60.67 
 
 		 539 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0675  putative carboxylase  58.81 
 
 		 538 aa  629  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3201  propionyl-CoA carboxylase  59 
 
 		 538 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0349643  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0289  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  60.19 
 
 		 538 aa  622  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2204  propionyl-CoA carboxylase  58.7 
 
 		 540 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.354632  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3260  propionyl-CoA carboxylase  58.6 
 
 		 540 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.395839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0327  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  58.63 
 
 		 536 aa  610  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2435  Propionyl-CoA carboxylase  58.15 
 
 		 540 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176472  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1897  propionyl-CoA carboxylase  56.89 
 
 		 538 aa  553  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3947  carboxyl transferase  48.8 
 
 		 538 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2818  propionyl-CoA carboxylase  50.19 
 
 		 536 aa  514  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0599136  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2804  propionyl-CoA carboxylase  48.43 
 
 		 538 aa  508  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896335  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2691  propionyl-CoA carboxylase  48.62 
 
 		 538 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165728  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2266  putative biotin-dependent carboxylase  48.43 
 
 		 538 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26720  putative biotin-dependent carboxylase  48.25 
 
 		 538 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0317  carboxyl transferase  46.95 
 
 		 537 aa  476  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10992  acetyl-/propionyl-CoA carboxylase beta subunit accD2  46.94 
 
 		 529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.20436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4686  propionyl-CoA carboxylase  46.96 
 
 		 530 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4848  propionyl-CoA carboxylase  46.53 
 
 		 549 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789174  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49550  Acyl-CoA carboxylase  46.79 
 
 		 535 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461683  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0948  carboxyl transferase domain-containing protein  47.45 
 
 		 535 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4392  propionyl-CoA carboxylase  46.96 
 
 		 530 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16510  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  48.55 
 
 		 528 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4306  propionyl-CoA carboxylase  46.96 
 
 		 530 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609915  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2032  propionyl-CoA carboxylase  46.34 
 
 		 535 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0210528  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4065  propionyl-CoA carboxylase  45.87 
 
 		 535 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.115987  hitchhiker  0.0000107516 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2055  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  47.45 
 
 		 535 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.370981  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1811  propionyl-CoA carboxylase  45.87 
 
 		 535 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141567  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0340  propionyl-CoA carboxylase  44.46 
 
 		 536 aa  462  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3663  propionyl-CoA carboxylase  45.87 
 
 		 535 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.000000000713312 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1607  carboxyl transferase domain-containing protein  47.26 
 
 		 535 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4433  Propionyl-CoA carboxylase  45.57 
 
 		 532 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0300749 
 
 
-
 
NC_004310  BR0019  carboxyl transferase family protein  46.15 
 
 		 535 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0653  carboxyl transferase domain-containing protein  47.26 
 
 		 535 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390861  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0803  carboxyl transferase domain-containing protein  47.26 
 
 		 535 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0038  propionyl-CoA carboxylase  45.97 
 
 		 535 aa  460  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0470  carboxyl transferase domain-containing protein  47.45 
 
 		 535 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1958  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  47.45 
 
 		 535 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1883  propionyl-CoA carboxylase  46.92 
 
 		 542 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314426  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1776  propionyl-CoA carboxylase  45.6 
 
 		 535 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212447 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0541  carboxyl transferase domain-containing protein  47.26 
 
 		 535 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2469  propionyl-CoA carboxylase  44.91 
 
 		 535 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6357  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  46.84 
 
 		 527 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  44.55 
 
 		 554 aa  458  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4327  propionyl-CoA carboxylase  47.37 
 
 		 533 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0134236 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0016  carboxyl transferase family protein  45.79 
 
 		 535 aa  457  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0163  carboxyl transferase  46.72 
 
 		 530 aa  458  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000870722  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2738  carboxyl transferase domain protein  44.87 
 
 		 535 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  44.26 
 
 		 535 aa  452  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0309  putative acyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  43.91 
 
 		 536 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3657  propionyl-CoA carboxylase  45.14 
 
 		 535 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361047  normal  0.0266441 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3561  propionyl-CoA carboxylase  45.54 
 
 		 535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.507215 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5055  carboxyl transferase  47.64 
 
 		 554 aa  455  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4767  carboxyl transferase  47.52 
 
 		 533 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.339159  decreased coverage  0.0000347279 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02413  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  42.52 
 
 		 535 aa  455  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2926  propionyl-CoA carboxylase  43.43 
 
 		 535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0930  carboxyl transferase  46.9 
 
 		 535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0422748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38460  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  45.97 
 
 		 535 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.509026 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1602  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  42.75 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5120  propionyl-CoA carboxylase  45.44 
 
 		 535 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0213028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0424  propionyl-CoA carboxylase  45.44 
 
 		 535 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0197  Propionyl-CoA carboxylase  46.47 
 
 		 536 aa  449  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.300462  normal  0.988787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3275  acyl-CoA carboxyltransferase subunit beta  45.79 
 
 		 535 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4722  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  43.96 
 
 		 542 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5033  propionyl-CoA carboxylase  45.44 
 
 		 535 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3467  propionyl-CoA carboxylase  45.62 
 
 		 535 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3433  Propionyl-CoA carboxylase  46.7 
 
 		 531 aa  451  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1457  propionyl-CoA carboxylase  44.71 
 
 		 535 aa  448  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.883387 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4687  Propionyl-CoA carboxylase  45.07 
 
 		 535 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.900437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3230  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  46.13 
 
 		 532 aa  449  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00712418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4587  propionyl-CoA carboxylase  45.26 
 
 		 535 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1896  3-methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  44.14 
 
 		 535 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  43.12 
 
 		 535 aa  448  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1791  hypothetical protein  43.3 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2798  propionyl-CoA carboxylase  43.33 
 
 		 553 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0961  propionyl-CoA carboxylase  45.17 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03804  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  45.65 
 
 		 536 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3128  propionyl-CoA carboxylase  45.26 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0763689  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3829  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  44.57 
 
 		 532 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.507183  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5239  propionyl-CoA carboxylase  45.26 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0128  Propionyl-CoA carboxylase  45.32 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.818447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4533  propionyl-CoA carboxylase  45.42 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0269  putative propionyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  45.7 
 
 		 535 aa  443  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2123  propionyl-CoA carboxylase  43.17 
 
 		 535 aa  442  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0145  propionyl-CoA carboxylase  44.22 
 
 		 546 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3224  propionyl-CoA carboxylase  43.98 
 
 		 535 aa  445  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.809195  normal  0.0163606 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2067  propionyl-CoA carboxylase  43.85 
 
 		 536 aa  442  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0120  Propionyl-CoA carboxylase  45.5 
 
 		 535 aa  445  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2395  propionyl-CoA carboxylase  43.96 
 
 		 535 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.955899 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2728  propionyl-CoA carboxylase  44.63 
 
 		 535 aa  444  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1671  carboxyl transferase  44.14 
 
 		 535 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1361  propionyl-CoA carboxylase  43.35 
 
 		 535 aa  444  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>