33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2852 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2852  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
183 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.049445  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4198  resolvase domain-containing protein  53.92 
 
 
205 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163134 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2368  Resolvase domain protein  44.79 
 
 
223 aa  85.9  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  decreased coverage  0.00000000117936 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0172  resolvase family site-specific recombinase  43.75 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08249  site-specific recombinase  40.21 
 
 
135 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  33.33 
 
 
217 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3410  Resolvase domain protein  34.38 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3142  resolvase-like protein  37.21 
 
 
203 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  34.15 
 
 
204 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0864  multiple promoter invertase  24.35 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186706 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  30.77 
 
 
211 aa  53.1  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  33 
 
 
193 aa  50.8  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  34.02 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  35 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  35.56 
 
 
200 aa  49.3  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  34 
 
 
192 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  34 
 
 
192 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  34 
 
 
191 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  33.33 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  35 
 
 
198 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1967  resolvase domain-containing protein  31.4 
 
 
252 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  34.52 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  34.52 
 
 
197 aa  42  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  38.57 
 
 
207 aa  42.4  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  34.52 
 
 
197 aa  42  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  31 
 
 
196 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  31 
 
 
196 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  31 
 
 
196 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  35 
 
 
193 aa  41.6  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  30.25 
 
 
196 aa  41.2  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  31.37 
 
 
190 aa  41.2  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  31.65 
 
 
185 aa  41.2  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  32.53 
 
 
197 aa  40.8  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>