More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6130 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  73.77 
 
 		 488 aa  737    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 492 aa  1012    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  73.16 
 
 		 488 aa  739    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  73.16 
 
 		 488 aa  749    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  73.98 
 
 		 488 aa  748    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  73.57 
 
 		 488 aa  737    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  71.31 
 
 		 487 aa  708    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  74.18 
 
 		 488 aa  746    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  73.16 
 
 		 488 aa  738    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  49.17 
 
 		 490 aa  490  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  50.52 
 
 		 496 aa  482  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.47 
 
 		 490 aa  481  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  49.48 
 
 		 490 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  48.74 
 
 		 492 aa  472  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  48.42 
 
 		 497 aa  466  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  48.11 
 
 		 494 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  48.64 
 
 		 490 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  48.11 
 
 		 494 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  47.9 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  48.11 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  47.9 
 
 		 494 aa  463  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  48.11 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  48.11 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  47.9 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  47.9 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  47.9 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  46.96 
 
 		 483 aa  461  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  48.22 
 
 		 483 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  46.54 
 
 		 494 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  46.33 
 
 		 494 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  46.33 
 
 		 494 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  46.33 
 
 		 494 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  46.33 
 
 		 494 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  46.33 
 
 		 494 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  47.48 
 
 		 473 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  47.69 
 
 		 483 aa  460  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  47.05 
 
 		 494 aa  456  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.06 
 
 		 498 aa  457  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  46.12 
 
 		 494 aa  457  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  45.91 
 
 		 494 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  45.91 
 
 		 494 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  46.33 
 
 		 494 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  48.95 
 
 		 494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  46.27 
 
 		 501 aa  451  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.74 
 
 		 508 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  45.81 
 
 		 502 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  45.64 
 
 		 493 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  44.05 
 
 		 488 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  44.05 
 
 		 488 aa  445  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  48.64 
 
 		 484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  45.44 
 
 		 493 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.01 
 
 		 493 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  45.31 
 
 		 493 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  45.51 
 
 		 493 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  45.1 
 
 		 493 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  45.31 
 
 		 493 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.99 
 
 		 493 aa  435  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05070  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  45.87 
 
 		 524 aa  433  1e-120  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63844  mitochondrial aldehyde dehydrogenase  45.26 
 
 		 501 aa  432  1e-120  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.704992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1527  transposase, IS605 OrfB family  50.48 
 
 		 421 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1838  Aldehyde Dehydrogenase  44.12 
 
 		 494 aa  433  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  43.61 
 
 		 503 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1942  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  45.45 
 
 		 495 aa  431  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  43.4 
 
 		 499 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1510  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.63 
 
 		 495 aa  425  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01288  hypothetical protein  44.21 
 
 		 495 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01277  gamma-Glu-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase, NAD(P)H-dependent  44.21 
 
 		 495 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2346  Aldehyde Dehydrogenase  44.21 
 
 		 495 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952724  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2325  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.42 
 
 		 495 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2372  Betaine-aldehyde dehydrogenase  45.23 
 
 		 495 aa  422  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1822  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.83 
 
 		 495 aa  423  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0935717 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  42.47 
 
 		 508 aa  424  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.54 
 
 		 494 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0049  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.79 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  46.09 
 
 		 494 aa  423  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  43.72 
 
 		 490 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1536  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.42 
 
 		 495 aa  423  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  44.54 
 
 		 491 aa  423  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1415  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.21 
 
 		 495 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09034  aldehyde dehydrogenase ALDH (AFU_orthologue; AFUA_8G02310)  45.38 
 
 		 511 aa  421  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.699324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  43.97 
 
 		 495 aa  419  1e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0965  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  42.77 
 
 		 507 aa  419  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  48.33 
 
 		 496 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1006  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.35 
 
 		 491 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179638  normal  0.457717 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  44.54 
 
 		 494 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0482  betaine aldehyde dehydrogenase  43.61 
 
 		 490 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2295  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  44.12 
 
 		 491 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6857  aldehyde dehydrogenase  46.47 
 
 		 502 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0656347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4196  Aldehyde Dehydrogenase  46.03 
 
 		 483 aa  416  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.115052  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1981  Aldehyde Dehydrogenase  42.68 
 
 		 502 aa  415  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.823861  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  42.14 
 
 		 492 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13620  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.72 
 
 		 497 aa  414  1e-114  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  43.45 
 
 		 506 aa  413  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7156  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.88 
 
 		 494 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3527  aldehyde dehydrogenase  43.66 
 
 		 495 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000694209  normal  0.0931426 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0338  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  45.23 
 
 		 513 aa  412  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1759  aldehyde dehydrogenase B  40.92 
 
 		 486 aa  413  1e-114  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  43.51 
 
 		 503 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1278  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.54 
 
 		 492 aa  409  1e-113  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000390072  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  41.3 
 
 		 490 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>