32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5648 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5648  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  410  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0693813  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0083  hypothetical protein  82.74 
 
 		 204 aa  336  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0555  hypothetical protein  61.05 
 
 		 199 aa  231  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.618914 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01414  hypothetical protein  59.6 
 
 		 199 aa  231  8.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278321  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2055  hypothetical protein  54.82 
 
 		 200 aa  218  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2423  hypothetical protein  45.77 
 
 		 202 aa  216  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4574  hypothetical protein  50 
 
 		 202 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0912  hypothetical protein  49.76 
 
 		 207 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.396439  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3083  transcriptional regulator-like protein  53.89 
 
 		 200 aa  205  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3048  hypothetical protein  45.65 
 
 		 187 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6555  hypothetical protein  45.6 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0940504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6340  hypothetical protein  40.8 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1304  hypothetical protein  45.05 
 
 		 197 aa  151  8e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0653  hypothetical protein  41.15 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.921551  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5453  hypothetical protein  41.33 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468294 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0507  hypothetical protein  39.89 
 
 		 203 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.689219  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0786  hypothetical protein  39.89 
 
 		 203 aa  146  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.232716  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0752  hypothetical protein  36.41 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1932  hypothetical protein  40.1 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3138  hypothetical protein  39.56 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4243  hypothetical protein  36.48 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3271  hypothetical protein  29.05 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3170  hypothetical protein  35.46 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.175438  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5577  hypothetical protein  29.89 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2854  hypothetical protein  30.89 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2875  hypothetical protein  33.81 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4515  hypothetical protein  29.29 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11062  hypothetical protein  32.14 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1284  abortive infection protein AbiGI  22.8 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0556  hypothetical protein  25.31 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000356919 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0679  hypothetical protein  21.56 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1797  hypothetical protein  21.56 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>