26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5323 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5323  protein of unknown function DUF718  100 
 
 		 109 aa  224  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6338  hypothetical protein  67.89 
 
 		 109 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00357939  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5480  protein of unknown function DUF718  66.97 
 
 		 113 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.299938  normal  0.858981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1219  hypothetical protein  65.14 
 
 		 113 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1246  hypothetical protein  64.22 
 
 		 113 aa  150  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1601  hypothetical protein  67.89 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0643  hypothetical protein  57.41 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.198224  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3138  hypothetical protein  64.22 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296679  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0645  hypothetical protein  66.06 
 
 		 112 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1781  hypothetical protein  65.14 
 
 		 112 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1991  protein of unknown function DUF718  53.7 
 
 		 110 aa  128  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.893292 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1086  hypothetical protein  64.08 
 
 		 106 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1163  hypothetical protein  64.08 
 
 		 106 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0819  hypothetical protein  64.08 
 
 		 106 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2046  hypothetical protein  49.07 
 
 		 110 aa  118  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5741  protein of unknown function DUF718  48.15 
 
 		 109 aa  117  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0374824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0311  protein of unknown function DUF718  52.29 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.881314 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0822  hypothetical protein  48.18 
 
 		 118 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000953829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4020  protein of unknown function DUF718  47.22 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02757  hypothetical protein  51.43 
 
 		 113 aa  90.5  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1543  hypothetical protein  40.54 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2427  hypothetical protein  37.63 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40891  predicted protein  36.84 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0314  hypothetical protein  28.3 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0240  hypothetical protein  23.3 
 
 		 114 aa  40.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0801  protein of unknown function DUF718  38.54 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.771693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>