More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4508 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4508  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 190 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.256059  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0122  GCN5-related N-acetyltransferase  45.88 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1730  GCN5-related N-acetyltransferase  35.12 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170022  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1764  GCN5-related N-acetyltransferase  33.73 
 
 		 182 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1479  putative ribosomal-protein-serine acetyltransferase  32.53 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.298398  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003996  putative ribosomal-protein-serine acetyltransferase  30.06 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.69551  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01526  hypothetical protein  33.1 
 
 		 182 aa  95.1  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2034  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000135176  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2901  GCN5-related N-acetyltransferase  25.53 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3672  putative acetyltransferase  32.53 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0390  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0241  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4576  GCN5-related N-acetyltransferase  31.98 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1073  ribosomal-protein (S5)-alanine N-acetyltransferase  31.21 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0342  GCN5-related N-acetyltransferase  25.74 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0909  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1456  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  24.53 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0264  GCN5-related N-acetyltransferase  27.53 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0679  GCN5-related N-acetyltransferase  30.51 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 334 aa  65.1  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0841  putative ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  28.49 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0824  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4797  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0597  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310523  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0310  GCN5-related N-acetyltransferase  25.14 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0534  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3435  GCN5-related N-acetyltransferase  31.18 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0309618  normal  0.570602 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0231  GCN5-related N-acetyltransferase  30.83 
 
 		 194 aa  62  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.394828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0311  acetyltransferase related protein  25.3 
 
 		 188 aa  62  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3105  GCN5-related N-acetyltransferase  35.92 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  21.43 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4651  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.444768 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2506  acetyltransferase-like  23.67 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.219044  normal  0.689211 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  26.63 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0482  acetyltransferase  28.4 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0992  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.12 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0487  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.4 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.19146  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  29.82 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1806  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6765  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0758  GCN5-related N-acetyltransferase  27.37 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451897  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01145  probable ribosomal-protein-serine acetyltransferase  26.06 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4320  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.37 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0144  acetyltransferase  28.57 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.660916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6345  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.881821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0633  GCN5-related N-acetyltransferase  32.48 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4804  acetyltransferase  24.03 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  24.03 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5168  acetyltransferase  24.03 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0207  acetyltransferase  19.5 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.742792  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2197  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0239  GCN5-related N-acetyltransferase  26.06 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4494  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.697146 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01310  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  25.45 
 
 		 338 aa  57  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3126  acetyltransferase  24.56 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.731723  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3026  GCN5-related N-acetyltransferase  23.12 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  29.06 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  29.06 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0690  GCN5-related N-acetyltransferase  32.48 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  29.06 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3361  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0664869  normal  0.190912 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.06 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  37.8 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.113437  decreased coverage  0.00454433 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0364  hypothetical protein  23.49 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.204641 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  29.06 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3526  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2032  GCN5-related N-acetyltransferase  27.05 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3089  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.482966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  29.06 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5077  acetyltransferase, GNAT family  21.97 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0585  GCN5-related N-acetyltransferase  27.38 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.424519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  30 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3425  acetyltransferase, gnat family  23.98 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3435  acetyltransferase  23.98 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1789  GCN5-related N-acetyltransferase  25.71 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166942  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  28.21 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1985  GCN5-related N-acetyltransferase  25.73 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.966311 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0766  GCN5-related N-acetyltransferase  28.25 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0700  GCN5-related N-acetyltransferase  20.45 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.503047  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459408  hitchhiker  0.00554726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1312  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0167578  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0694  GCN5-related N-acetyltransferase  27.17 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.720743 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1763  GCN5-related N-acetyltransferase  26 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.766793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5548  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.664924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2835  GCN5-related N-acetyltransferase  39.02 
 
 		 181 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.235365 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0168  acetyltransferase, GNAT family  22.08 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2685  GCN5-related N-acetyltransferase  31.19 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01621  conserved hypothetical protein  25.14 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.112063 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00910  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  32.81 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0680  GCN5-related N-acetyltransferase  25.45 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000882021  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6319  GCN5-related N-acetyltransferase  24.57 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  31.96 
 
 		 175 aa  51.6  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3412  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.885051 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1253  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0140  GCN5-related N-acetyltransferase  20.67 
 
 		 182 aa  51.6  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0185488 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0972  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 		 375 aa  51.6  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.407544  normal  0.945637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>