32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4293 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4293  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  721    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3788  hypothetical protein  68.01 
 
 		 350 aa  494  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2512  hypothetical protein  64.83 
 
 		 359 aa  478  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4327  hypothetical protein  65.01 
 
 		 346 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513809  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4550  hypothetical protein  64.72 
 
 		 346 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.33073  normal  0.671741 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4039  hypothetical protein  65.01 
 
 		 346 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0438234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3930  hypothetical protein  62.03 
 
 		 361 aa  455  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.939193  normal  0.0133603 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3486  hypothetical protein  64.72 
 
 		 346 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1850  hypothetical protein  60.64 
 
 		 361 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0216  hypothetical protein  62.57 
 
 		 346 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000223625  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3945  hypothetical protein  52.05 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.402122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3580  hypothetical protein  51.75 
 
 		 350 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1892  hypothetical protein  52.05 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2138  hypothetical protein  51.17 
 
 		 350 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0606225 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2312  hypothetical protein  50 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6046  hypothetical protein  43.56 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11100  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)  24.51 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2649  hypothetical protein  26.15 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1671  aminopeptidase (leucyl aminopeptidase, aminopeptidase T) 1  30.27 
 
 		 316 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0528  aminopeptidase  28.86 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2293  hypothetical protein  27.47 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.885941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0343  hypothetical protein  29.23 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2557  aminopeptidase  30.15 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1947  hypothetical protein  22.99 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000506957 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1162  hypothetical protein  26.48 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.607054  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3067  hypothetical protein  26.67 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0396  hypothetical protein  24.29 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0394  hypothetical protein  24.65 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2142  aminopeptidase  25.75 
 
 		 320 aa  53.1  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0511  hypothetical protein  25.24 
 
 		 476 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2684  Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  20.22 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4137  Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  24.64 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>