37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2991 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2991  pentapeptide MXKDX repeat protein  100 
 
 		 83 aa  146  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272043  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0540  hypothetical protein  69.32 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0298  pentapeptide MXKDX repeat protein  66.67 
 
 		 109 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0310  pentapeptide MXKDX repeat protein  66.67 
 
 		 109 aa  93.6  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2593  hypothetical protein  59.14 
 
 		 93 aa  93.6  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2731  hypothetical protein  63.86 
 
 		 83 aa  87  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172905 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1517  hypothetical protein  60.47 
 
 		 86 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3133  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  62.79 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal  0.206734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2814  pentapeptide MXKDX repeat protein  56.63 
 
 		 79 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.873208  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1511  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  54.17 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.144611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2530  hypothetical protein  58.62 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.234183 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4332  hypothetical protein  54.32 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.834965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2931  hypothetical protein  58.11 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2752  pentapeptide MXKDX repeat protein  40.51 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2570  pentapeptide MXKDX repeat protein  46.59 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1698  pentapeptide MXKDX repeat protein  40 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2179  hypothetical protein  56.34 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.565445 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1530  hypothetical protein  48.86 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0483  hypothetical protein  48.86 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0621  hypothetical protein  47.56 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1402  hypothetical protein  48.86 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1397  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  48.86 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0669  hypothetical protein  48.86 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.664868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1198  hypothetical protein  48.86 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0725407  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1196  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  54.76 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0762518  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2538  hypothetical protein  66 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0198  hypothetical protein  45.57 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2843  hypothetical protein  50 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4053  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1106  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  48.65 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1106  hypothetical protein  48.65 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227161  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4814  pentapeptide MXKDX repeat protein  44.58 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.901496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1200  pentapeptide MXKDX repeat protein  49.4 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.611594  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2665  pentapeptide MXKDX repeat protein  51.61 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0017  hypothetical protein  43.84 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02790  hypothetical protein  33.85 
 
 		 349 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.874218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5021  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  41.56 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978776  normal  0.0965687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>