263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2269 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2269  flagellar basal-body rod protein FlgC  100 
 
 		 153 aa  302  9.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.33 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.78 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3840  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.93 
 
 		 145 aa  104  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.89 
 
 		 137 aa  103  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.75 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.33 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.03 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.25 
 
 		 145 aa  100  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.56 
 
 		 146 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.06 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.58 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3114  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.75 
 
 		 147 aa  98.6  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4215  flagellar basal-body rod protein FlgC  36 
 
 		 146 aa  97.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3072  flagellar basal body rod protein  39.46 
 
 		 138 aa  97.4  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.103316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.55 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1977  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.58 
 
 		 135 aa  97.1  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.5 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.81 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3424  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.42 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2001  flagellar basal body rod protein FlgC  39.49 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0847  flagellar basal body rod protein  38.96 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.42 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  38.89 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.89 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  38.89 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  38.89 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  38.89 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  38.89 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  38.89 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  38.89 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  38.19 
 
 		 134 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  35.42 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  35.42 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  35.42 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0355  flagellar basal-body rod protein FlgC  34 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  36.55 
 
 		 134 aa  92.8  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0686  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.78 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  35.42 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  35.42 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  36.11 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.81 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2410  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.16 
 
 		 145 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1109  flagellar basal body rod protein FlgC  34.42 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151882  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1575  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.44 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1526  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.67 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  35.33 
 
 		 134 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2666  flagellar basal-body rod protein FlgC  34 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2719  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.37 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.78537  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0632  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.03 
 
 		 134 aa  90.5  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.69 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  37.24 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  36.81 
 
 		 134 aa  90.1  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  37.24 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  34.67 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  37.24 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.56 
 
 		 140 aa  90.1  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  37.24 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  37.24 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2285  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.89 
 
 		 145 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  37.24 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  37.24 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  37.24 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1213  flagellar basal body rod protein FlgC  36.24 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1194  flagellar basal-body rod protein FlgC  34 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  37.24 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3650  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.55 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  37.24 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  37.24 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1673  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.65 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2923  flagellar basal-body rod protein FlgC  38 
 
 		 134 aa  88.2  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2557  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.58 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0110618  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1396  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.58 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00396064  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2461  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.58 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0105073  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0927  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.91 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0568  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.33 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.24 
 
 		 140 aa  86.3  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.24 
 
 		 140 aa  86.3  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5626  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.86 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  35.17 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24010  flagellar basal-body rod protein  34.03 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3043  flagellar basal body rod protein FlgC  36.55 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2410  flagellar basal body rod protein FlgC  36.55 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3024  flagellar basal body rod protein FlgC  36.55 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0826465  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0074  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.58 
 
 		 139 aa  85.1  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4421  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.72 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3101  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.72 
 
 		 134 aa  84.7  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.653799  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3306  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.11 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01012  flagellar basal body rod protein FlgC  35.42 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392549  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06154  flagellar basal body rod protein FlgC  35.42 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000293747  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2934  flagellar basal body rod protein FlgC  36.55 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.725751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3069  flagellar basal body rod protein FlgC  36.55 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3828  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.72 
 
 		 134 aa  84.7  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0068  flagellar basal-body rod protein FlgC  30.92 
 
 		 139 aa  84.3  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0552  flagellar basal body rod protein FlgC  33.73 
 
 		 164 aa  84  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3970  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.21 
 
 		 138 aa  84.3  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3793  flagellar basal body rod protein FlgC  36.55 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0631  flagellar basal body rod protein FlgC  33.73 
 
 		 164 aa  83.6  8e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.662451  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0141  flagellar basal body rod protein FlgC  36.55 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3019  flagellar basal body rod protein FlgC  34.48 
 
 		 141 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>