13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0279 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0279  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00278726  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0218  hypothetical protein  54.41 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0169  hypothetical protein  58.56 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3927  hypothetical protein  53.96 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0290  hypothetical protein  52.04 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0341  hypothetical protein  52.48 
 
 		 222 aa  161  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0235  hypothetical protein  48.42 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0229  hypothetical protein  48.42 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1617  hypothetical protein  38.16 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.915111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0087  hypothetical protein  41.18 
 
 		 237 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.518244 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4048  hypothetical protein  40.1 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361653 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0687  hypothetical protein  30.37 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0121  hypothetical protein  25.56 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>