More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0848 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0848  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  699    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001604  glycosyl transferase family 3  48.02 
 
 		 317 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05584  hypothetical protein  48.02 
 
 		 317 aa  320  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3579  hypothetical protein  31.21 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1665  hypothetical protein  36.1 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3602  hypothetical protein  36.02 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3997  hypothetical protein  36.4 
 
 		 333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1836  hypothetical protein  36.4 
 
 		 333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000267985 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1507  glycosyl transferase family protein  39.68 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30360  hypothetical protein  31.83 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03656  hypothetical protein  35.52 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3401  hypothetical protein  33.43 
 
 		 334 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3342  glycosyl transferase, putative  35.71 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3172  hypothetical protein  35.32 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102896  normal  0.287439 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1873  glycosyl transferase family protein  34.66 
 
 		 376 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.597248  hitchhiker  0.00000310641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2599  hypothetical protein  30.93 
 
 		 327 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.733501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2530  hypothetical protein  33.07 
 
 		 361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2767  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.0391357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28160  hypothetical protein  33.46 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1161  hypothetical protein  32.43 
 
 		 327 aa  142  8e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.18822  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2812  glycosyl transferase family protein  35.07 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2381  hypothetical protein  31.02 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.0161209 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1809  glycosyl transferase family protein  32.78 
 
 		 408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3046  hypothetical protein  30.61 
 
 		 319 aa  122  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0326711  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1670  hypothetical protein  30.34 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0478591  normal  0.302071 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2358  Anthranilate phosphoribosyltransferase  33.02 
 
 		 346 aa  99.4  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4280  hypothetical protein  28.84 
 
 		 506 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3794  hypothetical protein  25.23 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516461  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3531  glycosyl transferase family protein  25.18 
 
 		 301 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0253  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3650  anthranilate phosphoribosyltransferase  29.88 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0815  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303571  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0234  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2842  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2331  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0852797  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4452  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0477  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.98 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1580  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2882  glycosyl transferase family protein  22.99 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2494  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2882  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1799  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.43 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000601677  normal  0.211733 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2104  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0754859  normal  0.466514 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1780  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.301488 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1467  glycosyl transferase family protein  24.28 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2690  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335373 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1403  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1487  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2369  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1594  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1210  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.76 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1290  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.127601  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0378  glycosyl transferase family protein  24.87 
 
 		 339 aa  67  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3098  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.54 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.813177 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2700  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.37 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0160  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.56 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2397  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1046  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.56 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0711  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.18 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0993387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3719  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.91 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.741915  normal  0.947635 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2293  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129801  normal  0.274195 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00767  hypothetical protein  24.69 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2842  Glycosyl transferase, family 3-like protein  24.69 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2016  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0352471  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.64 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.911757 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0949  glycosyl transferase family protein  24.69 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0855  glycosyl transferase family protein  24.69 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0867  glycosyl transferase family protein  24.69 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2001  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.18 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2843  glycosyl transferase family protein  24.69 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3619  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.64 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2573  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.31 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0532  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.31 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0824  glycosyl transferase family protein  24.69 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.993844 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00784  hypothetical protein  24.69 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0858  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3126  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.98 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.932329  normal  0.587762 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0949  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0885  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0917  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2142  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.55 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2761  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.98 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2862  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.64 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0578  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.56 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1821  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.15 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0274  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.226663 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1837  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.56 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2828  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.517689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0327  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3602  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.23 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219845  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3235  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1003  glycosyl transferase family protein  24.08 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0970  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0459  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.8 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  22.22 
 
 		 344 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3498  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.8 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432784  hitchhiker  0.000262957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4482  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.06 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0336855  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2884  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.61 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.38417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2552  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2797  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.67 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>