58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1907 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1907  putative ion channel  100 
 
 		 220 aa  440  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  36.21 
 
 		 228 aa  145  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  40 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  35.71 
 
 		 228 aa  128  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1842  Ion transport 2 domain-containing protein  47.29 
 
 		 208 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  35.27 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0647  ion transport family protein  41.88 
 
 		 247 aa  91.7  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  30 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0413  Ion transport 2 domain-containing protein  31.87 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1772  Ion transport 2 domain-containing protein  35.59 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1808  Ion transport 2 domain-containing protein  38.66 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0516361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  39.37 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1233  hypothetical protein  35.26 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0271776 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0500  Ion transport 2 domain protein  48.39 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0517  Ion transport 2 domain protein  48.39 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000756398  decreased coverage  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2231  Ion transport 2 domain protein  34.95 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2018  Ion transport 2 domain protein  38.05 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2482  Ion transport 2 domain protein  40 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.745368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19221  hypothetical protein  29.23 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0749  Ion transport 2 domain protein  27.27 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1459  Ion transport 2 domain-containing protein  33.91 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209929 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2859  Ion transport 2 domain protein  32.26 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4778  hypothetical protein  30.19 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0923  hypothetical protein  29.75 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.581577 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5186  putative Voltage-gated potassium channel  26.27 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.240486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54680  hypothetical protein  31.4 
 
 		 102 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238288  hitchhiker  0.00000298461 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  30.99 
 
 		 405 aa  52  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3734  hypothetical protein  29.29 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1485  hypothetical protein  27.05 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1489  Ion transport 2 domain protein  29.82 
 
 		 262 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670111  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  26.57 
 
 		 409 aa  48.9  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22810  hypothetical protein  34.88 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  33.33 
 
 		 295 aa  46.2  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3324  Ion transport 2 domain protein  31.15 
 
 		 223 aa  45.4  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304399  normal  0.471998 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  29.21 
 
 		 302 aa  45.4  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  27.45 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  34.78 
 
 		 393 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  36.36 
 
 		 509 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  26.23 
 
 		 331 aa  43.9  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  26.61 
 
 		 316 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0760  Ion transport 2 domain protein  27.2 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400355  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  32.2 
 
 		 272 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  26.24 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  36.84 
 
 		 269 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38821  predicted protein  34.29 
 
 		 469 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  33.33 
 
 		 276 aa  43.1  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  26.47 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  28.38 
 
 		 311 aa  42.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  37.1 
 
 		 271 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1320  Ion transport 2 domain protein  37.74 
 
 		 290 aa  42.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  32.32 
 
 		 279 aa  42.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  33.78 
 
 		 274 aa  42.4  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  22.95 
 
 		 325 aa  42.4  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17765  VIC family transporter: potassium ion channel, potassium voltage-gated channel, subfamily H (Eag-related)  36.54 
 
 		 735 aa  42.4  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000050158  hitchhiker  0.00697656 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0938  Ion transport 2 domain-containing protein  41.18 
 
 		 327 aa  42.4  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43171  predicted protein  26.67 
 
 		 448 aa  41.6  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.899265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1173  Ion transport 2 domain-containing protein  31.51 
 
 		 298 aa  42  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0673  potassium channel protein  37.68 
 
 		 428 aa  41.6  0.009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0468102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>