120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0740 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0740  putative DNA-binding protein  100 
 
 		 211 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1402  hypothetical protein  49.77 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2794  YheO domain-containing protein  50.7 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2877  YheO domain-containing protein  50.7 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2973  YheO domain-containing protein  50.23 
 
 		 226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3071  YheO domain-containing protein  50.23 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1208  YheO domain-containing protein  50 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3081  YheO domain-containing protein  50.23 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3224  YheO domain-containing protein  50.23 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1295  YheO domain protein  50.23 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2536  MukF protein  50.23 
 
 		 215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002894  putative DNA-binding protein  49.77 
 
 		 219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03080  hypothetical protein  50.23 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4888  YheO domain-containing protein  46.95 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00061  hypothetical protein  45.19 
 
 		 238 aa  164  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002293  hypothetical protein  45.19 
 
 		 226 aa  164  9e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000331987  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1636  hypothetical protein  42.11 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2767  hypothetical protein  44.71 
 
 		 240 aa  161  8.000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000230271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0312  YheO domain protein  44.93 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0394  YheO domain protein  44.08 
 
 		 249 aa  159  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00468087  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3834  YheO domain protein  44.08 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4014  YheO domain protein  43.6 
 
 		 248 aa  157  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.182407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3925  hypothetical protein  43.13 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000338087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4555  YheO domain-containing protein  42.18 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495528  normal  0.271247 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3682  hypothetical protein  43.13 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00382981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0271  YheO domain-containing protein  43.13 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835286  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3722  hypothetical protein  43.63 
 
 		 240 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000194242  normal  0.0632253 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3757  hypothetical protein  43.63 
 
 		 240 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0543637  normal  0.202333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3648  hypothetical protein  43.63 
 
 		 240 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000508468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3649  hypothetical protein  43.63 
 
 		 240 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000157298  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3820  hypothetical protein  43.63 
 
 		 240 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000148293  normal  0.984767 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0306  putative DNA-binding protein  42.58 
 
 		 237 aa  154  8e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0301161  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3043  YheO domain protein  40.19 
 
 		 218 aa  154  9e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03197  predicted DNA-binding transcriptional regulator  43.63 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000385535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0367  YheO domain protein  43.63 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3542  hypothetical protein  43.63 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.9543e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3815  hypothetical protein  43.63 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129937  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0367  YheO domain-containing protein  43.63 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.044939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3627  hypothetical protein  43.63 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000861494  hitchhiker  0.00116448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3720  hypothetical protein  43.63 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4655  hypothetical protein  43.63 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000142414  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03148  hypothetical protein  43.63 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000388396  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2028  YheO domain-containing protein  36.79 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0390581  normal  0.0444206 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3763  YheO domain-containing protein  43.63 
 
 		 240 aa  152  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000101154  hitchhiker  0.00366713 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4078  YheO domain-containing protein  34.11 
 
 		 226 aa  144  9e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0107  YheO domain-containing protein  34.58 
 
 		 226 aa  141  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0689  YheO domain-containing protein  34.13 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02785  hypothetical protein  35.05 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1492  YheO domain-containing protein  38.32 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3512  putative DNA-binding protein  33 
 
 		 225 aa  127  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.651472  normal  0.122215 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0265  YheO domain protein  30.81 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.205654  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3568  YheO domain-containing protein  34.29 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634176  normal  0.263492 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1030  YheO domain-containing protein  32.85 
 
 		 223 aa  95.5  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0810  hypothetical protein  32.85 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1803  YheO domain protein  33.98 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00197351  decreased coverage  0.000758988 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0038  YheO domain-containing protein  31.19 
 
 		 201 aa  91.3  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0400  YheO domain protein  29.38 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20890  YheO domain protein  32.2 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2109  YheO domain-containing protein  30.92 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.763786  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0235  YheO domain protein  30 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0613  YheO domain-containing protein  33.99 
 
 		 224 aa  89  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14000  hypothetical protein  32.2 
 
 		 210 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234213  normal  0.0113357 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1820  hypothetical protein  29.6 
 
 		 224 aa  88.2  7e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0120168  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0108  YheO domain protein  31.1 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1389  hypothetical protein  30.62 
 
 		 218 aa  87.4  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107006  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0420  YheO domain protein  30.77 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2931  YheO domain protein  29.49 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1578  hypothetical protein  30.62 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0968  hypothetical protein  31.55 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2761  YheO domain-containing protein  29.49 
 
 		 234 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1241  hypothetical protein  32.2 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0263  hypothetical protein  31.55 
 
 		 218 aa  85.9  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0541  hypothetical protein  32.39 
 
 		 210 aa  86.3  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1209  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  33.01 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2841  YheO domain-containing protein  28.44 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378743 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0602  YheO domain-containing protein  32.39 
 
 		 210 aa  86.3  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.156271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1367  YheO domain-containing protein  34.45 
 
 		 224 aa  85.5  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0276  helix-turn-helix containing protein  30.14 
 
 		 222 aa  84.7  9e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2540  YheO domain-containing protein  29.63 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2524  YheO domain-containing protein  26.83 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0563238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0722  YheO domain-containing protein  28.7 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0739  YheO domain-containing protein  28.7 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.074862 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3937  hypothetical protein  28.7 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0928038  hitchhiker  0.00381937 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0364  YheO-like  28.7 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0847  YheO domain-containing protein  28.7 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.262344  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2673  YheO domain-containing protein  28.79 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0819  YheO domain-containing protein  28.7 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229038  normal  0.717767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2434  YheO domain protein  30.54 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000217954  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0272  hypothetical protein  28.37 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1772  YheO domain protein  29.13 
 
 		 580 aa  78.6  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2073  YheO domain protein  28.17 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0868612 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3430  YheO domain-containing protein  28.64 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2566  YheO domain protein  28.7 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.086205  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3192  hypothetical protein  26.34 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1071  hypothetical protein  28.17 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5663  YheO domain protein  28.85 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.8397 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2000  YheO domain-containing protein  25.12 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35427  normal  0.0222508 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2654  YheO domain protein  27.36 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4371  hypothetical protein  29.36 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1494  hypothetical protein  27.31 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101034  normal  0.19833 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>