48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0466 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0466  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHI)  100 
 
 		 487 aa  1000    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0327432  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002365  MSHA biogenesis protein MshI  36.21 
 
 		 481 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03701  hypothetical protein  36.55 
 
 		 482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2817  MSHA biogenesis protein MshI  36.43 
 
 		 479 aa  289  7e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3666  fimbrial assembly family protein  26.02 
 
 		 200 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3489  hypothetical protein  25 
 
 		 200 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0451  hypothetical protein  26.13 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0463  hypothetical protein  24.49 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3772  biogenesis protein MshI  24.5 
 
 		 293 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0540  biogenesis protein MshI  29.09 
 
 		 304 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3839  biogenesis protein MshI  26.11 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0504  biogenesis protein MshI  26.11 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0480  biogenesis protein MshI  26.11 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4420  fimbrial assembly family protein  26.26 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0501  biogenesis protein MshI  26.11 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4421  biogenesis protein MshI  25.62 
 
 		 301 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0385  biogenesis protein MshI  27.54 
 
 		 292 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0557  hypothetical protein  26.02 
 
 		 200 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0556  biogenesis protein MshI  27.42 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4114.2  biogenesis protein MshI  23.62 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0750  fimbrial assembly family protein  24.74 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3667  biogenesis protein MshI  29.34 
 
 		 292 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3490  biogenesis protein MshI  27.42 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00247  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshI (pilus type IV)  25.68 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0502  hypothetical protein  24.51 
 
 		 200 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0462  biogenesis protein MshI  27.42 
 
 		 292 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.572153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0167  hypothetical protein  26.13 
 
 		 203 aa  68.6  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0505  hypothetical protein  24.51 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0481  hypothetical protein  24.51 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3838  hypothetical protein  24.51 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3351  biogenesis protein MshI  26.23 
 
 		 292 aa  67  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3350  hypothetical protein  22.92 
 
 		 202 aa  66.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3771  fimbrial assembly family protein  24.38 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0450  biogenesis protein MshI  25.45 
 
 		 289 aa  63.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3755  biogenesis protein MshI  26.2 
 
 		 301 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0541  fimbrial assembly family protein  25.65 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0386  fimbrial assembly family protein  23.02 
 
 		 201 aa  58.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0166  hypothetical protein  23.5 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0381  MshA biogenesis protein MshI-1  27.44 
 
 		 318 aa  57  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1131  hypothetical protein  25.12 
 
 		 313 aa  54.3  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1132  methionine sulfoxide reductase B  27.57 
 
 		 202 aa  54.7  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0749  hypothetical protein  25.39 
 
 		 308 aa  54.7  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.127849  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3754  hypothetical protein  23.81 
 
 		 182 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3336  hypothetical protein  29.91 
 
 		 365 aa  50.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00248  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshI (pilus type IV)  21.57 
 
 		 208 aa  48.9  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0889  hypothetical protein  23.96 
 
 		 308 aa  46.6  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0332  fimbrial assembly family protein  20.58 
 
 		 553 aa  45.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.715461  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3277  MshA biogenesis protein MshI-2  21.76 
 
 		 216 aa  43.5  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>