27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0481 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0481  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  403  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0505  hypothetical protein  99.5 
 
 
200 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3838  hypothetical protein  99.5 
 
 
200 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0502  hypothetical protein  98.5 
 
 
200 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3489  hypothetical protein  74 
 
 
200 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3666  fimbrial assembly family protein  73 
 
 
200 aa  304  6e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0463  hypothetical protein  73.5 
 
 
200 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0557  hypothetical protein  73.06 
 
 
200 aa  268  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4420  fimbrial assembly family protein  47.72 
 
 
200 aa  202  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0541  fimbrial assembly family protein  50.26 
 
 
203 aa  191  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3771  fimbrial assembly family protein  46.35 
 
 
202 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3754  hypothetical protein  51.45 
 
 
182 aa  169  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3350  hypothetical protein  47 
 
 
202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0386  fimbrial assembly family protein  45.45 
 
 
201 aa  145  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0451  hypothetical protein  41.15 
 
 
200 aa  138  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0167  hypothetical protein  33.51 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00248  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshI (pilus type IV)  32.11 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0466  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHI)  24.51 
 
 
487 aa  76.3  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0327432  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002365  MSHA biogenesis protein MshI  24.37 
 
 
481 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03701  hypothetical protein  23.32 
 
 
482 aa  71.6  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0750  fimbrial assembly family protein  26.88 
 
 
205 aa  62.4  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2817  MSHA biogenesis protein MshI  25.39 
 
 
479 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0382  MshA biogenesis protein MshI-2  24.76 
 
 
201 aa  51.6  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3277  MshA biogenesis protein MshI-2  22.92 
 
 
216 aa  51.6  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0761  hypothetical protein  26.83 
 
 
215 aa  49.7  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0217944  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3335  fimbrial assembly  25 
 
 
229 aa  49.3  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345488  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0332  fimbrial assembly family protein  25.61 
 
 
553 aa  42.4  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.715461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>