29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3277 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3277  MshA biogenesis protein MshI-2  100 
 
 		 216 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0750  fimbrial assembly family protein  35.64 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0382  MshA biogenesis protein MshI-2  36.07 
 
 		 201 aa  88.6  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1132  methionine sulfoxide reductase B  30.11 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00248  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshI (pilus type IV)  22.71 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0761  hypothetical protein  28.11 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0217944  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0332  fimbrial assembly family protein  33.76 
 
 		 553 aa  63.2  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.715461  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3771  fimbrial assembly family protein  25.95 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0502  hypothetical protein  22.92 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3838  hypothetical protein  22.92 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0505  hypothetical protein  22.92 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0481  hypothetical protein  22.92 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0167  hypothetical protein  26.34 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3666  fimbrial assembly family protein  23.88 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0466  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHI)  21.76 
 
 		 487 aa  52  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0327432  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3489  hypothetical protein  23.74 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0463  hypothetical protein  23.74 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0386  fimbrial assembly family protein  30.89 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3093  fimbrial assembly family protein  34.41 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3350  hypothetical protein  22.39 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0557  hypothetical protein  23.08 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4420  fimbrial assembly family protein  22.56 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0468  type IV pilus biogenesis protein PilN  21.14 
 
 		 188 aa  45.1  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0451  hypothetical protein  26.11 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3335  fimbrial assembly  25.26 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345488  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0541  fimbrial assembly family protein  22.61 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3754  hypothetical protein  22.53 
 
 		 182 aa  42.4  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002365  MSHA biogenesis protein MshI  20.79 
 
 		 481 aa  42.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1678  Fimbrial assembly family protein  23.97 
 
 		 204 aa  42.4  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>