28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0557 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0557  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0463  hypothetical protein  78.5 
 
 		 200 aa  323  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3666  fimbrial assembly family protein  77.5 
 
 		 200 aa  322  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3489  hypothetical protein  77.5 
 
 		 200 aa  321  6e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0505  hypothetical protein  73.06 
 
 		 200 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0502  hypothetical protein  73.06 
 
 		 200 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0481  hypothetical protein  73.06 
 
 		 200 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3838  hypothetical protein  73.06 
 
 		 200 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4420  fimbrial assembly family protein  49.74 
 
 		 200 aa  205  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0541  fimbrial assembly family protein  52.6 
 
 		 203 aa  198  6e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3771  fimbrial assembly family protein  52.06 
 
 		 202 aa  194  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3754  hypothetical protein  52.76 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3350  hypothetical protein  47.24 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0451  hypothetical protein  43.72 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0386  fimbrial assembly family protein  45.55 
 
 		 201 aa  140  9e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0167  hypothetical protein  35.42 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0466  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHI)  25.91 
 
 		 487 aa  82.4  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0327432  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00248  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshI (pilus type IV)  29.26 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03701  hypothetical protein  25.39 
 
 		 482 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2817  MSHA biogenesis protein MshI  27.75 
 
 		 479 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002365  MSHA biogenesis protein MshI  26.18 
 
 		 481 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0750  fimbrial assembly family protein  26.34 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0382  MshA biogenesis protein MshI-2  23.78 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0332  fimbrial assembly family protein  26.54 
 
 		 553 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.715461  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3335  fimbrial assembly  24.58 
 
 		 229 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345488  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00514  type IV pilus biogenesis protein PilN  24.71 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1132  methionine sulfoxide reductase B  25.53 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3277  MshA biogenesis protein MshI-2  21.65 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>