34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0332 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0332  fimbrial assembly family protein  100 
 
 		 553 aa  1089    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.715461  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0381  MshA biogenesis protein MshI-1  32.56 
 
 		 318 aa  99.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1131  hypothetical protein  27.15 
 
 		 313 aa  87  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3278  hypothetical protein  27.74 
 
 		 330 aa  85.9  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0749  hypothetical protein  31.1 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.127849  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0889  hypothetical protein  28.52 
 
 		 308 aa  75.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3092  hypothetical protein  30.23 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0750  fimbrial assembly family protein  34.44 
 
 		 205 aa  68.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0760  hypothetical protein  28.51 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0373973  normal  0.392235 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002365  MSHA biogenesis protein MshI  22.57 
 
 		 481 aa  64.3  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3277  MshA biogenesis protein MshI-2  33.76 
 
 		 216 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0166  hypothetical protein  22.01 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0382  MshA biogenesis protein MshI-2  36.59 
 
 		 201 aa  54.7  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3350  hypothetical protein  25.5 
 
 		 202 aa  53.5  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03701  hypothetical protein  21.67 
 
 		 482 aa  51.6  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0541  fimbrial assembly family protein  25.38 
 
 		 203 aa  50.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3772  biogenesis protein MshI  22.3 
 
 		 293 aa  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2817  MSHA biogenesis protein MshI  21.09 
 
 		 479 aa  50.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0450  biogenesis protein MshI  24.88 
 
 		 289 aa  48.9  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3336  hypothetical protein  23.67 
 
 		 365 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3666  fimbrial assembly family protein  24.54 
 
 		 200 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  23.98 
 
 		 352 aa  48.5  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4421  biogenesis protein MshI  22.27 
 
 		 301 aa  48.5  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4420  fimbrial assembly family protein  25.5 
 
 		 200 aa  48.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3351  biogenesis protein MshI  23.75 
 
 		 292 aa  48.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0463  hypothetical protein  26.51 
 
 		 200 aa  47.8  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0557  hypothetical protein  26.09 
 
 		 200 aa  45.8  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0975  type IV pilus assembly protein PilM  22.39 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4114.2  biogenesis protein MshI  22.78 
 
 		 292 aa  46.2  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0167  hypothetical protein  26.02 
 
 		 203 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0466  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHI)  20.58 
 
 		 487 aa  45.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0327432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0385  biogenesis protein MshI  22.43 
 
 		 292 aa  44.3  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0451  hypothetical protein  28.17 
 
 		 200 aa  44.3  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0462  biogenesis protein MshI  22.58 
 
 		 292 aa  43.5  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.572153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>