37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0749 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0749  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  618  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.127849  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3278  hypothetical protein  40.49 
 
 
330 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1131  hypothetical protein  36.73 
 
 
313 aa  123  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0381  MshA biogenesis protein MshI-1  33.59 
 
 
318 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0889  hypothetical protein  35.23 
 
 
308 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0760  hypothetical protein  30.13 
 
 
301 aa  96.7  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0373973  normal  0.392235 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0166  hypothetical protein  33.04 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3092  hypothetical protein  33.15 
 
 
307 aa  88.6  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3839  biogenesis protein MshI  29.87 
 
 
292 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0501  biogenesis protein MshI  29.87 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0450  biogenesis protein MshI  30.81 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0385  biogenesis protein MshI  31.46 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3667  biogenesis protein MshI  31.52 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3490  biogenesis protein MshI  30.35 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0462  biogenesis protein MshI  30.35 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.572153  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0540  biogenesis protein MshI  29.24 
 
 
304 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0504  biogenesis protein MshI  29.44 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0480  biogenesis protein MshI  28.74 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3755  biogenesis protein MshI  32.66 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00247  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshI (pilus type IV)  26.89 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4114.2  biogenesis protein MshI  29.95 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0332  fimbrial assembly family protein  31.1 
 
 
553 aa  79.7  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.715461  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0556  biogenesis protein MshI  29 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3772  biogenesis protein MshI  33.98 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4421  biogenesis protein MshI  28.71 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3351  biogenesis protein MshI  28.76 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3336  hypothetical protein  28.89 
 
 
365 aa  63.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1545  pilus-associated protein pilM  26.34 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.100373 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0466  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHI)  25.39 
 
 
487 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0327432  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2817  MSHA biogenesis protein MshI  32.04 
 
 
479 aa  50.8  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  23.95 
 
 
352 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  27.04 
 
 
345 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  29.56 
 
 
356 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  29.56 
 
 
356 aa  44.3  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2701  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  23.64 
 
 
332 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.942967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  24.2 
 
 
359 aa  42.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  23.2 
 
 
350 aa  42.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>