24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3350 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3350  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  396  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3666  fimbrial assembly family protein  45.54 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3771  fimbrial assembly family protein  49.48 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3489  hypothetical protein  45.13 
 
 		 200 aa  165  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0463  hypothetical protein  45.13 
 
 		 200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0557  hypothetical protein  47.24 
 
 		 200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0505  hypothetical protein  48.76 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3838  hypothetical protein  48.76 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0481  hypothetical protein  48.76 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0502  hypothetical protein  49.48 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0541  fimbrial assembly family protein  47.72 
 
 		 203 aa  158  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4420  fimbrial assembly family protein  43.94 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3754  hypothetical protein  45.25 
 
 		 182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0451  hypothetical protein  40 
 
 		 200 aa  141  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0386  fimbrial assembly family protein  42.79 
 
 		 201 aa  118  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002365  MSHA biogenesis protein MshI  27.84 
 
 		 481 aa  81.3  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03701  hypothetical protein  25.38 
 
 		 482 aa  75.1  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0466  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHI)  22.92 
 
 		 487 aa  70.5  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0327432  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00248  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshI (pilus type IV)  25.85 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2817  MSHA biogenesis protein MshI  27.13 
 
 		 479 aa  68.2  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0750  fimbrial assembly family protein  27.62 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0167  hypothetical protein  28.43 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0332  fimbrial assembly family protein  25.5 
 
 		 553 aa  53.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.715461  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3277  MshA biogenesis protein MshI-2  22.39 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>