23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3754 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3754  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3666  fimbrial assembly family protein  54.6 
 
 		 200 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3489  hypothetical protein  52.76 
 
 		 200 aa  175  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0463  hypothetical protein  52.15 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0502  hypothetical protein  51.45 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0505  hypothetical protein  51.45 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3838  hypothetical protein  51.45 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0481  hypothetical protein  51.45 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0557  hypothetical protein  52.76 
 
 		 200 aa  158  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4420  fimbrial assembly family protein  46.15 
 
 		 200 aa  150  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3771  fimbrial assembly family protein  47.37 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3350  hypothetical protein  47.17 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0541  fimbrial assembly family protein  47.27 
 
 		 203 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0386  fimbrial assembly family protein  45 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0451  hypothetical protein  42.86 
 
 		 200 aa  114  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2817  MSHA biogenesis protein MshI  29.63 
 
 		 479 aa  62.8  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03701  hypothetical protein  27.22 
 
 		 482 aa  59.3  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0167  hypothetical protein  27.62 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002365  MSHA biogenesis protein MshI  27.37 
 
 		 481 aa  55.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0466  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHI)  23.81 
 
 		 487 aa  52  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0327432  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00248  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshI (pilus type IV)  34.72 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3093  fimbrial assembly family protein  21.43 
 
 		 214 aa  42  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0750  fimbrial assembly family protein  23.95 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>